Protein–RNA interactions for Protein: Q12143

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1, yeastyeast

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSL1Q12143 SHE9YDR393W 1371 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 UBP3YER151C 2739 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YCS4YLR272C 3531 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 DPB11YJL090C 2295 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 AIM9YER080W 1884 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 SNO3YFL060C 669 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 VMA7YGR020C 357 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YAP3YHL009C 993 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 SEC22YLR268W 645 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 CMC4YMR194C-B 222 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YMR324CYMR324C 243 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 SNO2YNL334C 669 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 SUS1YBR111W-A 291 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 CDC39YCR093W 6327 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 NUP145YGL092W 3954 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 GDS1YOR355W 1569 nt0.7□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 APL3YBL037W 3078 nt0.69□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 DIA1YMR316W 1011 nt0.69□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YBL073WYBL073W 312 nt0.69□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 TYE7YOR344C 876 nt0.69□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 CLU1YMR012W 3834 nt0.69□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.68□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YBR184WYBR184W 1572 nt0.68□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 PAU2YEL049W 363 nt0.67□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 RPL16AYIL133C 600 nt0.67□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YCL046WYCL046W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 UTP13YLR222C 2454 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 GPM2YDL021W 936 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 CYC7YEL039C 342 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 CHZ1YER030W 462 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 IES5YER092W 378 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 NUP82YJL061W 2142 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
NSL1Q12143 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 REF2YDR195W 1602 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 KAR3YPR141C 2190 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RPL42BYHR141C 321 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 NBL1YHR199C-A 222 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RPS7BYNL096C 573 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RPL42AYNL162W 321 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 TOF2YKR010C 2316 nt0.65□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YDL068WYDL068W 330 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YDR248CYDR248C 582 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 PAM16YJL104W 450 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 TMA22YJR014W 597 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 SMD3YLR147C 306 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 NBP1YLR457C 960 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 SWT1YOR166C 1377 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 CDC24YAL041W 2565 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YCL020WYCL020W 1317 nt0.64□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 OST5YGL226C-A 261 nt0.63□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RIM20YOR275C 1986 nt0.63□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.62□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 RNR4YGR180C 1038 nt0.62□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 TIM8YJR135W-A 264 nt0.62□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 DAD1YDR016C 285 nt0.61□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.6□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 PAU18YLL064C 363 nt0.6□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 PAU6YNR076W 363 nt0.6□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YPR172WYPR172W 603 nt0.6□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 MPT5YGL178W 2580 nt0.6□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 NUT1YGL151W 3399 nt0.59□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.59□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YBR012CYBR012C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.59□□□□□ -2.31
NSL1Q12143 NUP120YKL057C 3114 nt0.59□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 APL2YKL135C 2181 nt0.59□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 NOC3YLR002C 1992 nt0.58□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 MXR1YER042W 555 nt0.58□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 SMB1YER029C 591 nt0.57□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 ARV1YLR242C 966 nt0.57□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 NUP157YER105C 4176 nt0.57□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 YDL206WYDL206W 2289 nt0.57□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 HDA3YPR179C 1968 nt0.56□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 AIM44YPL158C 2277 nt0.56□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 DFG10YIL049W 762 nt0.56□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.56□□□□□ -2.32
NSL1Q12143 YPL080CYPL080C 327 nt0.56□□□□□ -2.32
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