Protein–RNA interactions for Protein: Q08873

SCP1, Transgelin, yeastyeast

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCP1Q08873 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YJL114WYJL114W 681 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 SMD3YLR147C 306 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 HUG1YML058W-A 207 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 DLT1YMR126C 1029 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 DDR48YMR173W 1293 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YPR170CYPR170C 336 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 IQG1YPL242C 4488 nt0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YGR045CYGR045C 363 nt0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 SPO13YHR014W 876 nt0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 NEJ1YLR265C 1029 nt0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 VAB2YEL005C 849 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 MPT5YGL178W 2580 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 RSM27YGR215W 333 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 CGI121YML036W 546 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YOR199WYOR199W 330 nt0□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 BIR1YJR089W 2865 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 PAU2YEL049W 363 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 COX6YHR051W 447 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 NUT2YPR168W 474 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YBR224WYBR224W 516 nt-0.01□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YCR016WYCR016W 873 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YLR031WYLR031W 561 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 COX12YLR038C 252 nt-0.02□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 YMR324CYMR324C 243 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 SFG1YOR315W 1041 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 GPX2YBR244W 489 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 AIM44YPL158C 2277 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 DBP6YNR038W 1890 nt-0.03□□□□□ -2.41
SCP1Q08873 VIK1YPL253C 1944 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 GIC2YDR309C 1152 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SBH1YER087C-B 249 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 IMP3YHR148W 552 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 snR13snR13 124 nt-0.04□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 NUT1YGL151W 3399 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 VPS74YDR372C 1038 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YDR509WYDR509W 348 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 DUO1YGL061C 744 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YGR265WYGR265W 411 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YLR042CYLR042C 486 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YKE2YLR200W 345 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SEC8YPR055W 3198 nt-0.05□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SLI15YBR156C 2097 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 MLP2YIL149C 5040 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YOL014WYOL014W 375 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YOR105WYOR105W 327 nt-0.06□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 PKH2YOL100W 3246 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YDR262WYDR262W 819 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SLX9YGR081C 633 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 PAI3YMR174C 207 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YOR053WYOR053W 342 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YBP2YGL060W 1926 nt-0.07□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SAG1YJR004C 1953 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 NGG1YDR176W 2109 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 OCA6YDR067C 675 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 NBP1YLR457C 960 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 ATX1YNL259C 222 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 ARP9YMR033W 1404 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 STO1YMR125W 2586 nt-0.08□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 VPS52YDR484W 1926 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 SUT2YPR009W 807 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 YPR153WYPR153W 423 nt-0.09□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 NUR1YDL089W 1455 nt-0.1□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 NOC3YLR002C 1992 nt-0.1□□□□□ -2.42
SCP1Q08873 MKT1YNL085W 2493 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 ALY2YJL084C 3141 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 snR63snR63 255 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YER046W-AYER046W-A 330 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 UBC7YMR022W 498 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YBL073WYBL073W 312 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 STE5YDR103W 2754 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 SWI5YDR146C 2130 nt-0.1□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 PRP5YBR237W 2550 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 UBC9YDL064W 474 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 SDH2YLL041C 801 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 LCL2YLR104W 396 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 PEP3YLR148W 2757 nt-0.11□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 IST3YIR005W 447 nt-0.12□□□□□ -2.43
SCP1Q08873 LOA1YPR139C 903 nt-0.12□□□□□ -2.43
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