Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 SLM6YBR266C 453 nt-0.77□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 RRG1YDR065W 1098 nt-0.78□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 YGR042WYGR042W 816 nt-0.78□□□□□ -2.53
TOM1Q03280 PRP42YDR235W 1635 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 PEP3YLR148W 2757 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 snR8snR8 190 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YLR416CYLR416C 399 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YGL217CYGL217C 342 nt-0.79□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 HTB1YDR224C 396 nt-0.8□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 MET32YDR253C 576 nt-0.8□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 Q0142Q0142 177 nt-0.8□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 RPS27AYKL156W 249 nt-0.81□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YOR376WYOR376W 369 nt-0.81□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 INA17YPL099C 549 nt-0.81□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 SRN2YLR119W 642 nt-0.81□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 SPO77YLR341W 1434 nt-0.82□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YDL157CYDL157C 357 nt-0.82□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 PRM9YAR031W 897 nt-0.82□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 VPS28YPL065W 729 nt-0.82□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YBL077WYBL077W 432 nt-0.83□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 IME1YJR094C 1083 nt-0.83□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YLR053CYLR053C 327 nt-0.83□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt-0.84□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 PIG1YLR273C 1947 nt-0.84□□□□□ -2.54
TOM1Q03280 ERD2YBL040C 660 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 FIG1YBR040W 897 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 SLI15YBR156C 2097 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 RTR1YER139C 681 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YCL020WYCL020W 1317 nt-0.85□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 ORC3YLL004W 1851 nt-0.86□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YCR015CYCR015C 954 nt-0.86□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 CPR3YML078W 549 nt-0.86□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 RXT2YBR095C 1293 nt-0.86□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 NUT1YGL151W 3399 nt-0.87□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YOR314WYOR314W 330 nt-0.87□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 CDC10YCR002C 969 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 SST2YLR452C 2097 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YDR543CYDR543C 300 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YLR031WYLR031W 561 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 IRC14YOR135C 342 nt-0.88□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 snR84snR84 550 nt-0.89□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 BMT5YIL096C 1011 nt-0.89□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 MXR1YER042W 555 nt-0.89□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 ARP9YMR033W 1404 nt-0.9□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 SEC5YDR166C 2916 nt-0.9□□□□□ -2.55
TOM1Q03280 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt-0.91□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 MMS4YBR098W 2076 nt-0.91□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 PRM8YGL053W 714 nt-0.91□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 ATG10YLL042C 504 nt-0.92□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 YDL196WYDL196W 330 nt-0.92□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 HOP2YGL033W 657 nt-0.92□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 IRC19YLL033W 693 nt-0.93□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.93□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 DAS1YJL149W 1992 nt-0.94□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 SKI7YOR076C 2244 nt-0.94□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 YPR096CYPR096C 303 nt-0.95□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 GEP7YGL057C 864 nt-0.95□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 AAH1YNL141W 1044 nt-0.95□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 snR63snR63 255 nt-0.95□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 COBQ0105 1158 nt-0.95□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 RED1YLR263W 2484 nt-0.96□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 PSO2YMR137C 1986 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 SLX4YLR135W 2247 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 SLD3YGL113W 2007 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 SPO21YOL091W 1830 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 GSP1YLR293C 660 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 GDS1YOR355W 1569 nt-0.97□□□□□ -2.56
TOM1Q03280 BFR2YDR299W 1605 nt-0.98□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.98□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 COS12YGL263W 1143 nt-0.98□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 MNE1YOR350C 1992 nt-0.99□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 QCR7YDR529C 384 nt-0.99□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 ACB1YGR037C 264 nt-0.99□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 CCL1YPR025C 1182 nt-0.99□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 TOA1YOR194C 861 nt-0.99□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 JJJ2YJL162C 1752 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 RCN1YKL159C 636 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 GPG1YGL121C 381 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 SOV1YMR066W 2697 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YKL063CYKL063C 504 nt-1□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YEA4YEL004W 1029 nt-1.01□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 snR128snR128 126 nt-1.01□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 IMP3YHR148W 552 nt-1.02□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 PGA1YNL158W 597 nt-1.02□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YPD1YDL235C 504 nt-1.02□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 MUM2YBR057C 1101 nt-1.02□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YGL193CYGL193C 312 nt-1.03□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt-1.03□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 AIM36YMR157C 768 nt-1.03□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 GRX5YPL059W 453 nt-1.03□□□□□ -2.57
TOM1Q03280 RNA1YMR235C 1224 nt-1.04□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.7 ms