Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00205P59089 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00205P59089 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms