Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 COA6YMR244C-A 315 nt1.34□□□□□ -2.19
DDI1P40087 COX7YMR256C 183 nt1.34□□□□□ -2.19
DDI1P40087 AHC1YOR023C 1701 nt1.34□□□□□ -2.2
DDI1P40087 PIP2YOR363C 2991 nt1.34□□□□□ -2.2
DDI1P40087 FRK1YPL141C 2598 nt1.34□□□□□ -2.2
DDI1P40087 snR79snR79 84 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 VMA21YGR105W 234 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 RPC10YHR143W-A 213 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 PBY1YBR094W 2262 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 HKR1YDR420W 5409 nt1.33□□□□□ -2.2
DDI1P40087 GNT1YOR320C 1476 nt1.32□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YFL012WYFL012W 447 nt1.32□□□□□ -2.2
DDI1P40087 SWS2YNL081C 432 nt1.32□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YBR184WYBR184W 1572 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YJL022WYJL022W 309 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 SPC1YJR010C-A 285 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 RCN1YKL159C 636 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 AFB1YLR040C 675 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YOL159CYOL159C 516 nt1.31□□□□□ -2.2
DDI1P40087 ALK1YGL021W 2283 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 CRG1YHR209W 876 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 ABM1YJR108W 372 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YLR140WYLR140W 327 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 MEI5YPL121C 669 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 PMD1YER132C 5262 nt1.3□□□□□ -2.2
DDI1P40087 SMB1YER029C 591 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YHL037CYHL037C 402 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YIL029CYIL029C 429 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 PFD1YJL179W 330 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YOR152CYOR152C 771 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 EGD1YPL037C 474 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 NCA2YPR155C 1851 nt1.29□□□□□ -2.2
DDI1P40087 IRR1YIL026C 3453 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 SEC21YNL287W 2808 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 CDC36YDL165W 576 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YER121WYER121W 345 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 PKR1YMR123W 369 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 FMP23YBR047W 528 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 YPR177CYPR177C 372 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 DOT6YER088C 2013 nt1.28□□□□□ -2.2
DDI1P40087 KAP122YGL016W 3246 nt1.28□□□□□ -2.21
DDI1P40087 SEF1YBL066C 3447 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 OSH6YKR003W 1347 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 RVS161YCR009C 798 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 CIC1YHR052W 1131 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YJR079WYJR079W 330 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 COF1YLL050C 432 nt1.27□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.26□□□□□ -2.21
DDI1P40087 RPL42BYHR141C 321 nt1.26□□□□□ -2.21
DDI1P40087 RPL42AYNL162W 321 nt1.26□□□□□ -2.21
DDI1P40087 CDC24YAL041W 2565 nt1.26□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YJL015CYJL015C 285 nt1.25□□□□□ -2.21
DDI1P40087 VPS55YJR044C 423 nt1.25□□□□□ -2.21
DDI1P40087 HHT1YBR010W 411 nt1.25□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YCL046WYCL046W 324 nt1.25□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MSH5YDL154W 2706 nt1.25□□□□□ -2.21
DDI1P40087 EST2YLR318W 2655 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 PHR1YOR386W 1698 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 HNT1YDL125C 477 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YGR265WYGR265W 411 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 GMC2YLR445W 567 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YBL073WYBL073W 312 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 SLM6YBR266C 453 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MSS11YMR164C 2277 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 DGR2YKL121W 2559 nt1.24□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MTC7YEL033W 420 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YPR146CYPR146C 330 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MVP1YMR004W 1536 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MAK10YEL053C 2202 nt1.23□□□□□ -2.21
DDI1P40087 PRM8YGL053W 714 nt1.22□□□□□ -2.21
DDI1P40087 MLH3YPL164C 2148 nt1.22□□□□□ -2.21
DDI1P40087 SMC4YLR086W 4257 nt1.22□□□□□ -2.21
DDI1P40087 YDL152WYDL152W 366 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 QCR7YDR529C 384 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YGR283CYGR283C 1026 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 EMC5YIL027C 426 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 PAU18YLL064C 363 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 PAU6YNR076W 363 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 CDC31YOR257W 486 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 IRC16YPR038W 360 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 CDC25YLR310C 4770 nt1.21□□□□□ -2.22
DDI1P40087 PPN1YDR452W 2025 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 TRM732YMR259C 4263 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 OCA6YDR067C 675 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YKL044WYKL044W 321 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 FCF2YLR051C 654 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 BER1YLR412W 825 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YNL114CYNL114C 372 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YSY6YBR162W-A 198 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 RAD9YDR217C 3930 nt1.2□□□□□ -2.22
DDI1P40087 IML1YJR138W 4755 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YDL016CYDL016C 303 nt1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms