Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAD1O00515 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms