Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHLDB3Q6NSJ2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHLDB3Q6NSJ2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms