Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 KEL2YGR238C 2649 nt2.69□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 SOK2YMR016C 2358 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 CDC53YDL132W 2448 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 NUP120YKL057C 3114 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 YFH1YDL120W 525 nt2.68□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 YRB1YDR002W 606 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 LSO2YGR169C-A 279 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 VTI1YMR197C 654 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 YBL071CYBL071C 309 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 YOR055WYOR055W 435 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 BFA1YJR053W 1725 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 SLN1YIL147C 3663 nt2.67□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 SRO77YBL106C 3033 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 KAR3YPR141C 2190 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 TMA22YJR014W 597 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 EMC6YLL014W 327 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 CDC24YAL041W 2565 nt2.66□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 MET18YIL128W 3099 nt2.65□□□□□ -1.98
SLX4Q12098 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YER121WYER121W 345 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RTR1YER139C 681 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 SNC1YAL030W 354 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YNL058CYNL058C 951 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YPR146CYPR146C 330 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 CRM1YGR218W 3255 nt2.65□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 BNR1YIL159W 4128 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 SWT1YOR166C 1377 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 PHO2YDL106C 1680 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 VPS35YJL154C 2835 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 TIM9YEL020W-A 264 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RTT102YGR275W 474 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 FCF2YLR051C 654 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 KTI11YBL071W-A 249 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YOR121CYOR121C 306 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 SNC2YOR327C 348 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RTC6YPL183W-A 282 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YPL238CYPL238C 390 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 BUB1YGR188C 3066 nt2.64□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 ARP8YOR141C 2646 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YAP6YDR259C 1152 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RPS17AYML024W 411 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YPR097WYPR097W 3222 nt2.63□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YEF3YLR249W 3135 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 MRP10YDL045W-A 288 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YBL108WYBL108W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YPR197CYPR197C 564 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 PDR3YBL005W 2931 nt2.62□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RIC1YLR039C 3171 nt2.61□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 SGD1YLR336C 2700 nt2.61□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.61□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 MLH1YMR167W 2310 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 STE11YLR362W 2154 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 PAU14YIL176C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 PAU1YJL223C 363 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.6□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YGL024WYGL024W 336 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 PSY1YKL076C 384 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 YOR333CYOR333C 417 nt2.59□□□□□ -1.99
SLX4Q12098 CLN3YAL040C 1743 nt2.59□□□□□ -2
SLX4Q12098 NUM1YDR150W 8247 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 PHO91YNR013C 2685 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 SPO22YIL073C 2928 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 YDR286CYDR286C 345 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 YGR035CYGR035C 351 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 MSB1YOR188W 3414 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 SGS1YMR190C 4344 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 UBR1YGR184C 5853 nt2.58□□□□□ -2
SLX4Q12098 TRA1YHR099W 11235 nt2.57□□□□□ -2
SLX4Q12098 MNE1YOR350C 1992 nt2.56□□□□□ -2
SLX4Q12098 SPF1YEL031W 3648 nt2.56□□□□□ -2
SLX4Q12098 RPL9BYNL067W 576 nt2.56□□□□□ -2
SLX4Q12098 CDC27YBL084C 2277 nt2.56□□□□□ -2
SLX4Q12098 VPH1YOR270C 2523 nt2.56□□□□□ -2
SLX4Q12098 VPS41YDR080W 2979 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 SIR4YDR227W 4077 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 TMN3YER113C 2121 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 TMA10YLR327C 261 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 YPL182CYPL182C 384 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.55□□□□□ -2
SLX4Q12098 GRR1YJR090C 3456 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 RTT107YHR154W 3213 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 QCR7YDR529C 384 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 RPS20YHL015W 366 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 CSF1YLR087C 8877 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 SWR1YDR334W 4545 nt2.54□□□□□ -2
SLX4Q12098 TRL1YJL087C 2484 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 RAV1YJR033C 4074 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 DOT6YER088C 2013 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 MGM1YOR211C 2646 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 YGL069CYGL069C 465 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 DAD3YBR233W-A 285 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 PDR11YIL013C 4236 nt2.53□□□□□ -2
SLX4Q12098 YJR003CYJR003C 1560 nt2.53□□□□□ -2.01
SLX4Q12098 VTC3YPL019C 2508 nt2.52□□□□□ -2.01
SLX4Q12098 IST2YBR086C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
SLX4Q12098 YDL011CYDL011C 324 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.8 ms