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Protein–RNA interactions for Protein: P53047
RTA1, Protein RTA1, yeast
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317 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTA1
P53047
TOF2
YKR010C
2316 nt
2.87
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
BFA1
YJR053W
1725 nt
2.87
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
GIS1
YDR096W
2685 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
AMS1
YGL156W
3252 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
SMD1
YGR074W
441 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YIL059C
YIL059C
366 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
HCH1
YNL281W
462 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YBR277C
YBR277C
402 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
SMY1
YKL079W
1971 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
SNF5
YBR289W
2718 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
SPO71
YDR104C
3738 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
CRM1
YGR218W
3255 nt
2.86
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
INP51
YIL002C
2841 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
AFI1
YOR129C
2682 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YDR366C
YDR366C
399 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
ERP6
YGL002W
651 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YAL042C-A
YAL042C-A
378 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YBL065W
YBL065W
345 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
ALK2
YBL009W
2031 nt
2.85
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YFL063W
YFL063W
456 nt
2.84
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YGL149W
YGL149W
306 nt
2.84
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
TAR1
YLR154W-C
375 nt
2.84
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
YMR290W-A
YMR290W-A
348 nt
2.84
□□□□□ -1.95
RTA1
P53047
HSC82
YMR186W
2118 nt
2.84
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
RAX2
YLR084C
3663 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YGR050C
YGR050C
357 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
NOP10
YHR072W-A
177 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YML037C
YML037C
1023 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
BCK1
YJL095W
4437 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
OSW7
YFR039C
1533 nt
2.83
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
HMRA2
YCR096C
360 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YIL174W
YIL174W
228 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YJL222W-A
YJL222W-A
228 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
TMA10
YLR327C
261 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
RPL32
YBL092W
393 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
SEC7
YDR170C
6030 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YBR184W
YBR184W
1572 nt
2.82
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
PAN3
YKL025C
2040 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
MRD1
YPR112C
2664 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
ESL1
YIL151C
3357 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
INP52
YNL106C
3552 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
snR8
snR8
190 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YMR320W
YMR320W
306 nt
2.81
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
CBF2
YGR140W
2871 nt
2.8
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
DYN2
YDR424C
279 nt
2.8
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
PNC1
YGL037C
651 nt
2.8
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
KAP104
YBR017C
2757 nt
2.8
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YNL018C
YNL018C
1839 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
PAC1
YOR269W
1485 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
SMY2
YBR172C
2223 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
RPL35A
YDL191W
363 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YHR063W-A
YHR063W-A
336 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
HTB2
YBL002W
396 nt
2.79
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
TUS1
YLR425W
3924 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
ESL2
YKR096W
3588 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
OSH6
YKR003W
1347 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
PHS1
YJL097W
654 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
RPS22A
YJL190C
393 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
YLR154W-E
YLR154W-E
204 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
COX14
YML129C
213 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
MRPL33
YMR286W
261 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
AXL1
YPR122W
3627 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
SWA2
YDR320C
2007 nt
2.78
□□□□□ -1.96
RTA1
P53047
TRS130
YMR218C
3309 nt
2.78
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
PEP3
YLR148W
2757 nt
2.78
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
CDC27
YBL084C
2277 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
TMN3
YER113C
2121 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
GEA1
YJR031C
4227 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YGL069C
YGL069C
465 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
SNC1
YAL030W
354 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
snR51
snR51
107 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
MNL2
YLR057W
2550 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YLR149C
YLR149C
2193 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
SCH9
YHR205W
2475 nt
2.77
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
OST1
YJL002C
1431 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
RIM20
YOR275C
1986 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
SEF1
YBL066C
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2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
VPH1
YOR270C
2523 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
PRP8
YHR165C
7242 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
CDC53
YDL132W
2448 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YBR224W
YBR224W
516 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
RPO41
YFL036W
4056 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
PFF1
YBR074W
2931 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
PEX8
YGR077C
1770 nt
2.76
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
SEC26
YDR238C
2922 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
EMC6
YLL014W
327 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
HHT1
YBR010W
411 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YPL150W
YPL150W
2706 nt
2.75
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YDR098C-B
YDR098C-B
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YDR210C-D
YDR210C-D
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YDR316W-B
YDR316W-B
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YDR365W-B
YDR365W-B
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YER138C
YER138C
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YER160C
YER160C
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YGR038C-B
YGR038C-B
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YGR161C-D
YGR161C-D
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YJR027W
YJR027W
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YLR157C-B
YLR157C-B
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
RTA1
P53047
YML039W
YML039W
5268 nt
2.74
□□□□□ -1.97
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