Protein–RNA interactions for Protein: P38796

PPE1, Protein phosphatase methylesterase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPE1P38796 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.69□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.69□□□□□ -1.98
PPE1P38796 DNA2YHR164C 4569 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 PNC1YGL037C 651 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 AYR1YIL124W 894 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YPL182CYPL182C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YPL229WYPL229W 621 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 snR43snR43 209 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 PSK2YOL045W 3306 nt2.68□□□□□ -1.98
PPE1P38796 BCK1YJL095W 4437 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 ISW1YBR245C 3390 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 AMS1YGL156W 3252 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 DAD4YDR320C-A 219 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YMR324CYMR324C 243 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 LSM7YNL147W 348 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 TAO3YIL129C 7131 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 SLN1YIL147C 3663 nt2.67□□□□□ -1.98
PPE1P38796 IPT1YDR072C 1584 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 VPS41YDR080W 2979 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 HMRA2YCR096C 360 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 snR8snR8 190 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 PSY1YKL076C 384 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YOR050CYOR050C 348 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 YJL070CYJL070C 2667 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 JSN1YJR091C 3276 nt2.66□□□□□ -1.98
PPE1P38796 KSP1YHR082C 3090 nt2.65□□□□□ -1.98
PPE1P38796 INP53YOR109W 3324 nt2.65□□□□□ -1.98
PPE1P38796 SEC26YDR238C 2922 nt2.65□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YPR146CYPR146C 330 nt2.65□□□□□ -1.99
PPE1P38796 ESL2YKR096W 3588 nt2.65□□□□□ -1.99
PPE1P38796 MPH1YIR002C 2982 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 RTT10YPL183C 3042 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 HSC82YMR186W 2118 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 GIN4YDR507C 3429 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 BNR1YIL159W 4128 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 TOP2YNL088W 4287 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 RKM1YPL208W 1752 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 VPS16YPL045W 2397 nt2.64□□□□□ -1.99
PPE1P38796 REV1YOR346W 2958 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 OST1YJL002C 1431 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 RPS24AYER074W 408 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YFL063WYFL063W 456 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YGL239CYGL239C 315 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 CAF120YNL278W 3183 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 FAR11YNL127W 2862 nt2.63□□□□□ -1.99
PPE1P38796 AIM9YER080W 1884 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YDR186CYDR186C 2634 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 MZM1YDR493W 372 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YNL010WYNL010W 726 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YBR277CYBR277C 402 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 PDR1YGL013C 3207 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 HOS4YIL112W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 PFF1YBR074W 2931 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 TRS130YMR218C 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
PPE1P38796 UBP11YKR098C 2154 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 NOT5YPR072W 1683 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 LSO2YGR169C-A 279 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 RPS29AYLR388W 171 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 PTP3YER075C 2787 nt2.61□□□□□ -1.99
PPE1P38796 RPO41YFL036W 4056 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 PTC5YOR090C 1719 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 GRX8YLR364W 330 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YMR320WYMR320W 306 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 MMS22YLR320W 4365 nt2.6□□□□□ -1.99
PPE1P38796 SAP1YER047C 2694 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YNL018CYNL018C 1839 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 OSW7YFR039C 1533 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 QCR7YDR529C 384 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 MCM22YJR135C 720 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 YEL043WYEL043W 2871 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 PDR3YBL005W 2931 nt2.59□□□□□ -1.99
PPE1P38796 DIS3YOL021C 3006 nt2.59□□□□□ -2
PPE1P38796 NCL1YBL024W 2055 nt2.59□□□□□ -2
PPE1P38796 KAR3YPR141C 2190 nt2.59□□□□□ -2
PPE1P38796 FKS3YMR306W 5358 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 SMD1YGR074W 441 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 TIM13YGR181W 318 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 HSK3YKL138C-A 210 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 YLR255CYLR255C 354 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 SRO77YBL106C 3033 nt2.58□□□□□ -2
PPE1P38796 NEW1YPL226W 3591 nt2.57□□□□□ -2
PPE1P38796 FLO11YIR019C 4104 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms