Protein–RNA interactions for Protein: P25369

LSB5, LAS seventeen-binding protein 5, yeastyeast

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSB5P25369 PDR11YIL013C 4236 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 REV1YOR346W 2958 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 SHE2YKL130C 741 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 LSM7YNL147W 348 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YBL108WYBL108W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 DAD3YBR233W-A 285 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 PDR1YGL013C 3207 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 VPS13YLL040C 9435 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 INP53YOR109W 3324 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 FAR11YNL127W 2862 nt2.12□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 CAJ1YER048C 1176 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YFR056CYFR056C 369 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 RPS29AYLR388W 171 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 COX7YMR256C 183 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 TSC3YBR058C-A 243 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YJL016WYJL016W 1686 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 PTC5YOR090C 1719 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YEF3YLR249W 3135 nt2.11□□□□□ -2.07
LSB5P25369 VTI1YMR197C 654 nt2.1□□□□□ -2.07
LSB5P25369 MRPL50YNR022C 420 nt2.1□□□□□ -2.07
LSB5P25369 ERP4YOR016C 624 nt2.1□□□□□ -2.07
LSB5P25369 NCL1YBL024W 2055 nt2.1□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YOL098CYOL098C 3114 nt2.09□□□□□ -2.07
LSB5P25369 SEC16YPL085W 6588 nt2.09□□□□□ -2.07
LSB5P25369 LCL2YLR104W 396 nt2.09□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YOR050CYOR050C 348 nt2.09□□□□□ -2.07
LSB5P25369 YPR039WYPR039W 336 nt2.09□□□□□ -2.07
LSB5P25369 TOF1YNL273W 3717 nt2.09□□□□□ -2.08
LSB5P25369 SGS1YMR190C 4344 nt2.09□□□□□ -2.08
LSB5P25369 MPH1YIR002C 2982 nt2.09□□□□□ -2.08
LSB5P25369 VPS52YDR484W 1926 nt2.09□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YJL070CYJL070C 2667 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 NAN1YPL126W 2691 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 DNA2YHR164C 4569 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 IPT1YDR072C 1584 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 KRE33YNL132W 3171 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 FMP16YDR070C 282 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PEX17YNL214W 600 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 VMA9YCL005W-A 222 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 SKP2YNL311C 2292 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YEL043WYEL043W 2871 nt2.08□□□□□ -2.08
LSB5P25369 SNX41YDR425W 1878 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 EDS1YBR033W 2760 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 MZM1YDR493W 372 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 AYR1YIL124W 894 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YAR068WYAR068W 486 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YOR055WYOR055W 435 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 snR13snR13 124 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 snR36snR36 182 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 UBR1YGR184C 5853 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 GNT1YOR320C 1476 nt2.07□□□□□ -2.08
LSB5P25369 GIS1YDR096W 2685 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 STE5YDR103W 2754 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 BFA1YJR053W 1725 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YDL041WYDL041W 354 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 VOA1YGR106C 798 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PRE8YML092C 753 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 ISF1YMR081C 1017 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YMR324CYMR324C 243 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YNL010WYNL010W 726 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YOL160WYOL160W 342 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 OSW7YFR039C 1533 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 TAE2YPL009C 3117 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YLL032CYLL032C 2478 nt2.06□□□□□ -2.08
LSB5P25369 IRC10YOL015W 1761 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 MKT1YNL085W 2493 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 NOP10YHR072W-A 177 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PFD1YJL179W 330 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PAU8YAL068C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 GRX8YLR364W 330 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PAU20YOL161C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 PDR3YBL005W 2931 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 RRP6YOR001W 2202 nt2.05□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YDR186CYDR186C 2634 nt2.04□□□□□ -2.08
LSB5P25369 BNI1YNL271C 5862 nt2.03□□□□□ -2.08
LSB5P25369 RAV1YJR033C 4074 nt2.03□□□□□ -2.08
LSB5P25369 snR70snR70 164 nt2.03□□□□□ -2.08
LSB5P25369 ATP17YDR377W 306 nt2.03□□□□□ -2.08
LSB5P25369 YGL041CYGL041C 204 nt2.03□□□□□ -2.08
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