Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 CFT2YLR115W 2580 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YEL043WYEL043W 2871 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YGL024WYGL024W 336 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YGL069CYGL069C 465 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YMR324CYMR324C 243 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 HEH2YDR458C 1992 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 SPT23YKL020C 3249 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 DIP2YLR129W 2832 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 SKT5YBL061C 2091 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 AIM11YER093C-A 414 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YNL211CYNL211C 261 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 SNF2YOR290C 5112 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 RPB2YOR151C 3675 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 SOD1YJR104C 465 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 RPL20BYOR312C 519 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YPR003CYPR003C 2265 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 PLC1YPL268W 2610 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 NCR1YPL006W 3513 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 MSK1YNL073W 1731 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 CDC20YGL116W 1833 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 PAA1YDR071C 576 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 PRE4YFR050C 801 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YOR218CYOR218C 420 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YPR014CYPR014C 330 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 snR191snR191 274 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 URB2YJR041C 3525 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 DBP7YKR024C 2229 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 MCM10YIL150C 1716 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 NPR1YNL183C 2373 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 SMT3YDR510W 306 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 LSO2YGR169C-A 279 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 EMC6YLL014W 327 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 RNR1YER070W 2667 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 MLH2YLR035C 2088 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-BLQ12266 KRE5YOR336W 4098 nt3.59□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 SIP3YNL257C 3690 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 SPC105YGL093W 2754 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 RPO31YOR116C 4383 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 DOT6YER088C 2013 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 ALK2YBL009W 2031 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 KAR3YPR141C 2190 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 TRK1YJL129C 3708 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 SEG1YMR086W 2883 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 RAD54YGL163C 2697 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 ZRG17YNR039C 1818 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 CLN3YAL040C 1743 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 KIN2YLR096W 3444 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 RAM2YKL019W 951 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 SWC7YLR385C 399 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YOR333CYOR333C 417 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 RIX1YHR197W 2292 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 MCD4YKL165C 2760 nt3.56□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YDL176WYDL176W 2127 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YDR089WYDR089W 2610 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 OST4YDL232W 111 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 ATP7YKL016C 525 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 CAF130YGR134W 3369 nt3.55□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 YKL050CYKL050C 2769 nt3.54□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 MSD1YPL104W 1977 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 RPS17BYDR447C 411 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 FRT2YAL028W 1587 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 IOC2YLR095C 2439 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 MTC4YBR255W 2085 nt3.53□□□□□ -1.84
TY1A-BLQ12266 COS111YBR203W 2775 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 TMA17YDL110C 453 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YDR193WYDR193W 399 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 CMC4YMR194C-B 222 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YBL065WYBL065W 345 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 RRM3YHR031C 2172 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 SWH1YAR042W 3567 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 ELG1YOR144C 2376 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 REG1YDR028C 3045 nt3.52□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YOL075CYOL075C 3885 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 PAN3YKL025C 2040 nt3.51□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YNR065CYNR065C 3351 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 CHD1YER164W 4407 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 RPL25YOL127W 429 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 EFR3YMR212C 2349 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 SWI1YPL016W 3945 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 MPT5YGL178W 2580 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 GIN4YDR507C 3429 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 ZDS1YMR273C 2748 nt3.5□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 PTC5YOR090C 1719 nt3.49□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 ABP140YOR239W 1887 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 MSH2YOL090W 2895 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 RPL22AYLR061W 366 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 RPL33AYPL143W 324 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.48□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 YDR239CYDR239C 2364 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 DUF1YOL087C 3351 nt3.47□□□□□ -1.85
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