Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.18□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.18□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 NAB3YPL190C 2409 nt3.18□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 PDR12YPL058C 4536 nt3.18□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 LYS9YNR050C 1341 nt3.18□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 FLO1YAR050W 4614 nt3.17□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 YDR048CYDR048C 315 nt3.17□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 ALG13YGL047W 609 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 PHS1YJL097W 654 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 ROG1YGL144C 2058 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 JIP5YPR169W 1479 nt3.16□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 CHS2YBR038W 2892 nt3.15□□□□□ -1.9
TMA46Q12000 FMP32YFL046W 624 nt3.15□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 BLI1YKL061W 342 nt3.15□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RPL20AYMR242C 519 nt3.15□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 NCL1YBL024W 2055 nt3.15□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.14□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 ATG26YLR189C 3597 nt3.14□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 KEL2YGR238C 2649 nt3.14□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 DBP6YNR038W 1890 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 PTC5YOR090C 1719 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 UBP11YKR098C 2154 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YDL062WYDL062W 426 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YDL211CYDL211C 1119 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RPS27AYKL156W 249 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RPL36AYMR194W 303 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 FPR1YNL135C 345 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YPR089WYPR089W 2667 nt3.13□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 SGD1YLR336C 2700 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RBK1YCR036W 1002 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 MRPL33YMR286W 261 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 SPO71YDR104C 3738 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 KSP1YHR082C 3090 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 DOT6YER088C 2013 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 AKR1YDR264C 2295 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 HRD3YLR207W 2502 nt3.12□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 VPS35YJL154C 2835 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 SIN3YOL004W 4611 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 PRP6YBR055C 2700 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 NMD2YHR077C 3270 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YGL069CYGL069C 465 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YHL041WYHL041W 450 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YIL102CYIL102C 306 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 SAR1YPL218W 573 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 BCH1YMR237W 2175 nt3.11□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 CDC36YDL165W 576 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YBT1YLL048C 4986 nt3.1□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 MDM1YML104C 3384 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 MMS1YPR164W 4224 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RAD61YDR014W 1944 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 RRP12YPL012W 3687 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 YBL065WYBL065W 345 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 DUG2YBR281C 2637 nt3.09□□□□□ -1.91
TMA46Q12000 FUN30YAL019W 3396 nt3.09□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 LRG1YDL240W 3054 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 SMD1YGR074W 441 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 snR49snR49 165 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 ARP7YPR034W 1434 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 RGA2YDR379W 3030 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 GIS4YML006C 2325 nt3.08□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 MCD1YDL003W 1701 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 BFA1YJR053W 1725 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 PAN3YKL025C 2040 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YIL032CYIL032C 357 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YIL059CYIL059C 366 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YML037CYML037C 1023 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 DAD3YBR233W-A 285 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 FLO5YHR211W 3228 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 TSC11YER093C 4293 nt3.07□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 FIR1YER032W 2631 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YHR080CYHR080C 4038 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YSP2YDR326C 4317 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 ROM1YGR070W 3468 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 SDH2YLL041C 801 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 SNC2YOR327C 348 nt3.06□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YFH1YDL120W 525 nt3.05□□□□□ -1.92
TMA46Q12000 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt3.05□□□□□ -1.92
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