Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPB1P53618 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPB1P53618 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPB1P53618 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPB1P53618 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms