Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 HMRA2YCR096C 360 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 snR8snR8 190 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 PAU14YIL176C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 PAU1YJL223C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 FPR1YNL135C 345 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 OST1YJL002C 1431 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 UTP14YML093W 2700 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 YPK1YKL126W 2043 nt2.22□□□□□ -2.05
AVT5P38176 YNL034WYNL034W 1839 nt2.21□□□□□ -2.05
AVT5P38176 SSY1YDR160W 2559 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 NUM1YDR150W 8247 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YEL057CYEL057C 702 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 HMF1YER057C 390 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 APC9YLR102C 798 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RPS22BYLR367W 393 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 COX7YMR256C 183 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SAK1YER129W 3429 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YHR078WYHR078W 1659 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 IKI3YLR384C 4050 nt2.21□□□□□ -2.06
AVT5P38176 COX1Q0045 1605 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SSN2YDR443C 4263 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 BNR1YIL159W 4128 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 ECM5YMR176W 4236 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 snR76snR76 109 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 ADK1YDR226W 669 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RPS17BYDR447C 411 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 ERP6YGL002W 651 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 AIM32YML050W 936 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YMR320WYMR320W 306 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 PGA1YNL158W 597 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 ARP8YOR141C 2646 nt2.2□□□□□ -2.06
AVT5P38176 PSK2YOL045W 3306 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 GIN4YDR507C 3429 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 LEU3YLR451W 2661 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 MRPL33YMR286W 261 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YPL238CYPL238C 390 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 DAD3YBR233W-A 285 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 FAR11YNL127W 2862 nt2.19□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SVL3YPL032C 2478 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SUL1YBR294W 2580 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 TPS2YDR074W 2691 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YIL166CYIL166C 1629 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 CAJ1YER048C 1176 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YER189WYER189W 369 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YLR012CYLR012C 300 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YLR031WYLR031W 561 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 PRE8YML092C 753 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RGM1YMR182C 636 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 IRC23YOR044W 474 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YJL016WYJL016W 1686 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 NAB3YPL190C 2409 nt2.18□□□□□ -2.06
AVT5P38176 STE5YDR103W 2754 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SEC26YDR238C 2922 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 GCN4YEL009C 846 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RPL36AYMR194W 303 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 SWR1YDR334W 4545 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 PCF11YDR228C 1881 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 TRS130YMR218C 3309 nt2.17□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YFR056CYFR056C 369 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YIL058WYIL058W 285 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 NCE101YJL205C 162 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RPL26AYLR344W 384 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YML037CYML037C 1023 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RPL9BYNL067W 576 nt2.16□□□□□ -2.06
AVT5P38176 PHO2YDL106C 1680 nt2.15□□□□□ -2.06
AVT5P38176 NUP82YJL061W 2142 nt2.15□□□□□ -2.06
AVT5P38176 VPS52YDR484W 1926 nt2.15□□□□□ -2.06
AVT5P38176 MSS11YMR164C 2277 nt2.15□□□□□ -2.06
AVT5P38176 RLI1YDR091C 1827 nt2.15□□□□□ -2.06
AVT5P38176 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.15□□□□□ -2.07
AVT5P38176 SHE2YKL130C 741 nt2.15□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YIL080WYIL080W 4722 nt2.15□□□□□ -2.07
AVT5P38176 BAS1YKR099W 2436 nt2.15□□□□□ -2.07
AVT5P38176 SMY2YBR172C 2223 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YBP1YBR216C 2025 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 RPL39YJL189W 156 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 MCM22YJR135C 720 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YEF3YLR249W 3135 nt2.14□□□□□ -2.07
AVT5P38176 RPO41YFL036W 4056 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 SDC25YLL016W 3147 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YDL041WYDL041W 354 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 HOP2YGL033W 657 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 HYR1YIR037W 492 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 ISF1YMR081C 1017 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YBL073WYBL073W 312 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 RPL25YOL127W 429 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YPL229WYPL229W 621 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 VMA9YCL005W-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 AMS1YGL156W 3252 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YKU80YMR106C 1890 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 KAP123YER110C 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 NAN1YPL126W 2691 nt2.13□□□□□ -2.07
AVT5P38176 NOT5YPR072W 1683 nt2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 118.3 ms