Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SS18Q15532 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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SS18Q15532 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SS18Q15532 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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