Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 CCL1YPR025C 1182 nt0.62□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.62□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YER189WYER189W 369 nt0.61□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 TEN1YLR010C 483 nt0.61□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CUP9YPL177C 921 nt0.61□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 RXT2YBR095C 1293 nt0.61□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CET1YPL228W 1650 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 FMN1YDR236C 657 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 RNH202YDR279W 1053 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YAP3YHL009C 993 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YKL177WYKL177W 339 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YOR152CYOR152C 771 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 YDR132CYDR132C 1488 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 CRM1YGR218W 3255 nt0.6□□□□□ -2.31
TY2B-DR1Q12472 POL4YCR014C 1749 nt0.59□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.59□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YAR068WYAR068W 486 nt0.59□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 LTP1YPR073C 486 nt0.59□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 SAS3YBL052C 2496 nt0.58□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 COG8YML071C 1824 nt0.58□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 KAR9YPL269W 1935 nt0.58□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 IES5YER092W 378 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 SNC1YAL030W 354 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 ATG38YLR211C 681 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 NSL1YPL233W 651 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 PRP39YML046W 1890 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 NOP53YPL146C 1368 nt0.57□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 MTC7YEL033W 420 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YMR181CYMR181C 465 nt0.56□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 BTN2YGR142W 1233 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YPR063CYPR063C 423 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 CUR1YPR158W 759 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 CLG1YGL215W 1359 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 SLK19YOR195W 2466 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 SEC8YPR055W 3198 nt0.55□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 CLB5YPR120C 1308 nt0.54□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.54□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YSW1YBR148W 1830 nt0.54□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 ACA1YER045C 1470 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 YIL161WYIL161W 708 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 ATG10YLL042C 504 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 ASM4YDL088C 1587 nt0.53□□□□□ -2.32
TY2B-DR1Q12472 PES4YFR023W 1836 nt0.53□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YJL211CYJL211C 444 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YBR063CYBR063C 1215 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 COX1Q0045 1605 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YEA4YEL004W 1029 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 MRP49YKL167C 414 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 GIM3YNL153C 390 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 CSI2YOL007C 1026 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 SNC2YOR327C 348 nt0.52□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 NSE4YDL105W 1209 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 NSE3YDR288W 912 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 ARK1YNL020C 1917 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YDR338CYDR338C 2088 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 APC5YOR249C 2058 nt0.51□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 CSE1YGL238W 2883 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 RPL40AYIL148W 387 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 SPC1YJR010C-A 285 nt0.5□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 ERV14YGL054C 417 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YGR273CYGR273C 525 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 EPT1YHR123W 1176 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 VPS55YJR044C 423 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 RIF2YLR453C 1188 nt0.49□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 WHI3YNL197C 1986 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 MUK1YPL070W 1839 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YCR108CYCR108C 192 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YGL177WYGL177W 348 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 CTL1YMR180C 963 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 SPP381YBR152W 876 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 AZF1YOR113W 2745 nt0.48□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YJL022WYJL022W 309 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 PRM6YML047C 1059 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 NGL1YOL042W 1092 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 NCA2YPR155C 1851 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YML002WYML002W 2214 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YGR064WYGR064W 369 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YGR190CYGR190C 366 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 YNL179CYNL179C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 PET123YOR158W 957 nt0.47□□□□□ -2.33
TY2B-DR1Q12472 UFE1YOR075W 1041 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 MYO1YHR023W 5787 nt0.46□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 DIG2YDR480W 972 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YIP1YGR172C 747 nt0.45□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 SVP26YHR181W 687 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 HIR3YJR140C 4947 nt0.44□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 ALK1YGL021W 2283 nt0.43□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.43□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 snR191snR191 274 nt0.43□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YEL028WYEL028W 462 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YNL010WYNL010W 726 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YOR203WYOR203W 354 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt0.42□□□□□ -2.34
TY2B-DR1Q12472 JJJ2YJL162C 1752 nt0.42□□□□□ -2.34
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