Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 HPA3YEL066W 540 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YIL058WYIL058W 285 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YKL136WYKL136W 399 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 snR43snR43 209 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 ITC1YGL133W 3795 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 SGS1YMR190C 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 RLF2YPR018W 1821 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 RPL27BYDR471W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 BAT1YHR208W 1182 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 AIM32YML050W 936 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 EGD1YPL037C 474 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YPL225WYPL225W 441 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YJR098CYJR098C 1971 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 TIM11YDR322C-A 291 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 CGI121YML036W 546 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YOR146WYOR146W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 APC2YLR127C 2562 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YIL166CYIL166C 1629 nt2.71□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YDL068WYDL068W 330 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 CCW14YLR390W-A 717 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 ATP15YPL271W 189 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YOL057WYOL057W 2136 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 DUF1YOL087C 3351 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PSK2YOL045W 3306 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 TRM2YKR056W 1920 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 MOT1YPL082C 5604 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 RPS22AYJL190C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PTP3YER075C 2787 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 SOK1YDR006C 2706 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YJL016WYJL016W 1686 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 BCK1YJL095W 4437 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 POM152YMR129W 4014 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 AXL1YPR122W 3627 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 HYR1YIR037W 492 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 COX7YMR256C 183 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 CDC20YGL116W 1833 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YGR067CYGR067C 2415 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 NAB3YPL190C 2409 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PDR3YBL005W 2931 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 NET1YJL076W 3570 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 SEC26YDR238C 2922 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 RTT10YPL183C 3042 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 ADK1YDR226W 669 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 VTI1YMR197C 654 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 SSE1YPL106C 2082 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YAT2YER024W 2772 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 GIN4YDR507C 3429 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PDR1YGL013C 3207 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YPK1YKL126W 2043 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 TOM1YDR457W 9807 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 CAJ1YER048C 1176 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YER189WYER189W 369 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PRE4YFR050C 801 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PNC1YGL037C 651 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 URM1YIL008W 300 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 NUP82YJL061W 2142 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 RPS22BYLR367W 393 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YOR105WYOR105W 327 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 TPS2YDR074W 2691 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 COX1Q0045 1605 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 BRO1YPL084W 2535 nt2.67□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 NEW1YPL226W 3591 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 BPT1YLL015W 4680 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 MMS1YPR164W 4224 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 CDC50YCR094W 1176 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 RPL14BYHL001W 417 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 NCE101YJL205C 162 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 ABM1YJR108W 372 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 MRPL31YKL138C 396 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 PUF4YGL014W 2667 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YJR003CYJR003C 1560 nt2.66□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 VPS41YDR080W 2979 nt2.65□□□□□ -1.98
LCB4Q12246 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.65□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 LCL2YLR104W 396 nt2.65□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 COQ10YOL008W 624 nt2.65□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 ECM25YJL201W 1800 nt2.65□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PUF6YDR496C 1971 nt2.65□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 PSY2YNL201C 2577 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 VPS52YDR484W 1926 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 SKT5YBL061C 2091 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YER181CYER181C 324 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YIL174WYIL174W 228 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 YKL118WYKL118W 312 nt2.64□□□□□ -1.99
LCB4Q12246 RPL25YOL127W 429 nt2.64□□□□□ -1.99
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