Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHKA1P46020 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHKA1P46020 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms