Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 BFA1YJR053W 1725 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CAJ1YER048C 1176 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SMD1YGR074W 441 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 RNR4YGR180C 1038 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 LRP1YHR081W 555 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 AIM19YIL087C 474 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 BET4YJL031C 984 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YLR053CYLR053C 327 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SPC72YAL047C 1869 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 BI4Q0120 1917 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 GRR1YJR090C 3456 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SLX9YGR081C 633 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC28P40509 VMA21YGR105W 234 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SCEIQ0160 708 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC28P40509 SSY1YDR160W 2559 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 PDR8YLR266C 2106 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 APM3YBR288C 1452 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CAT2YML042W 2013 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 GRX8YLR364W 330 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 ICY1YMR195W 384 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 URA10YMR271C 684 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 YNL010WYNL010W 726 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC28P40509 CRM1YGR218W 3255 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 MDM32YOR147W 1869 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YDL187CYDL187C 330 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 MZM1YDR493W 372 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 CHZ1YER030W 462 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YGL015CYGL015C 393 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YKR051WYKR051W 1257 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPB11YOL005C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YPR096CYPR096C 303 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC28P40509 SPO22YIL073C 2928 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 PUT3YKL015W 2940 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 AFR1YDR085C 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 UBP2YOR124C 3819 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YDR286CYDR286C 345 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YGR283CYGR283C 1026 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YML084WYML084W 309 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YDR341CYDR341C 1824 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 HER1YOR227W 3741 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPL37BYDR500C 267 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPS24AYER074W 408 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 HOP2YGL033W 657 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 TEN1YLR010C 483 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPL37AYLR185W 267 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 CSI1YMR025W 888 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YPL039WYPL039W 951 nt2.06□□□□□ -2.08
SEC28P40509 SYH1YPL105C 2550 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 NEO1YIL048W 3456 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 BRP1YGL007W 378 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 AIM18YHR198C 966 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPI1YIL119C 1224 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 PHO80YOL001W 882 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YOR152CYOR152C 771 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 ROX1YPR065W 1107 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 SOK2YMR016C 2358 nt2.05□□□□□ -2.08
SEC28P40509 MGA2YIR033W 3342 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 UBP1YDL122W 2430 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YIR020CYIR020C 303 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 ATP15YPL271W 189 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 SPP41YDR464W 4308 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 CFT2YLR115W 2580 nt2.04□□□□□ -2.08
SEC28P40509 GYP5YPL249C 2685 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 SEC31YDL195W 3822 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 BNA7YDR428C 786 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YPS5YGL259W 498 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 VOA1YGR106C 798 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 TIM10YHR005C-A 282 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 ATP7YKL016C 525 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RLP24YLR009W 600 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YLR031WYLR031W 561 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 RPS7BYNL096C 573 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YPR147CYPR147C 915 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 YPR172WYPR172W 603 nt2.03□□□□□ -2.08
SEC28P40509 MGM1YOR211C 2646 nt2.03□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 NAM7YMR080C 2916 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YDL068WYDL068W 330 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 PEA2YER149C 1263 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 RMP1YLR145W 606 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YLR252WYLR252W 306 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 NOP14YDL148C 2433 nt2.02□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YDL118WYDL118W 381 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC28P40509 TIM8YJR135W-A 264 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YKL123WYKL123W 381 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC28P40509 TMA7YLR262C-A 195 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC28P40509 YBL012CYBL012C 402 nt2.01□□□□□ -2.09
SEC28P40509 PET309YLR067C 2898 nt2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.4 ms