Protein–RNA interactions for Protein: P32610

VMA8, V-type proton ATPase subunit D, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VMA8P32610 YDL068WYDL068W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YDR042CYDR042C 603 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 OCA6YDR067C 675 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 BNA7YDR428C 786 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 HOP2YGL033W 657 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SPO13YHR014W 876 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SPC1YJR010C-A 285 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YKL123WYKL123W 381 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 AFB1YLR040C 675 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YOR050CYOR050C 348 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RPS12YOR369C 432 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 MGM1YOR211C 2646 nt2.14□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SPP41YDR464W 4308 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 CFT2YLR115W 2580 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 PET309YLR067C 2898 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YAP5YIR018W 738 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RPA34YJL148W 702 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RLP24YLR009W 600 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YLR031WYLR031W 561 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 TMA7YLR262C-A 195 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YOR055WYOR055W 435 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YPR172WYPR172W 603 nt2.13□□□□□ -2.07
VMA8P32610 TOR2YKL203C 7425 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YIL029CYIL029C 429 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RMP1YLR145W 606 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 GMC2YLR445W 567 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RPS7BYNL096C 573 nt2.12□□□□□ -2.07
VMA8P32610 HCS1YKL017C 2052 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 VPS35YJL154C 2835 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 UTP13YLR222C 2454 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 TDA9YML081W 3756 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 TIM8YJR135W-A 264 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SNC2YOR327C 348 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 ATP15YPL271W 189 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RPH1YER169W 2391 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 NUP120YKL057C 3114 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 NUP82YJL061W 2142 nt2.11□□□□□ -2.07
VMA8P32610 NAB6YML117W 3405 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 NOP14YDL148C 2433 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SEC31YDL195W 3822 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 BRP1YGL007W 378 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 BUD19YJL188C 309 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YLR271WYLR271W 825 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 UBP2YOR124C 3819 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YPL197CYPL197C 414 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 STB4YMR019W 2850 nt2.1□□□□□ -2.07
VMA8P32610 GCN2YDR283C 4980 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SCD5YOR329C 2619 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 CDC27YBL084C 2277 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 YDL062WYDL062W 426 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 RTR2YDR066C 591 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 SWS2YNL081C 432 nt2.09□□□□□ -2.07
VMA8P32610 ELG1YOR144C 2376 nt2.09□□□□□ -2.08
VMA8P32610 HNT1YDL125C 477 nt2.08□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.08□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YJL016WYJL016W 1686 nt2.07□□□□□ -2.08
VMA8P32610 PUT3YKL015W 2940 nt2.06□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.06□□□□□ -2.08
VMA8P32610 CYB5YNL111C 363 nt2.06□□□□□ -2.08
VMA8P32610 SGS1YMR190C 4344 nt2.06□□□□□ -2.08
VMA8P32610 STE11YLR362W 2154 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YCR064CYCR064C 411 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YDL158CYDL158C 309 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YDR220CYDR220C 294 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YGL069CYGL069C 465 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 NCE101YJL205C 162 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 COA4YLR218C 453 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 RTC6YPL183W-A 282 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 GPX2YBR244W 489 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.05□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 SET2YJL168C 2202 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 BER1YLR412W 825 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 PGA1YNL158W 597 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 RBL2YOR265W 321 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YPL238CYPL238C 390 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 NEO1YIL048W 3456 nt2.04□□□□□ -2.08
VMA8P32610 MUD2YKL074C 1584 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 SPR3YGR059W 1539 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 DNA2YHR164C 4569 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 RSE1YML049C 4086 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 COX13YGL191W 390 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 YKL111CYKL111C 336 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 SEC22YLR268W 645 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 DGK1YOR311C 873 nt2.03□□□□□ -2.08
VMA8P32610 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.9 ms