Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.25e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT215.14■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-206ENST00000620717 1432 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-203ENST00000427175 2623 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 59.44□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.325e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 21.9
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 414.91□□□□□ -0.025e-7■■■■□ 21.9
UTP18Q9Y5J1 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 316.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 516.42■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-216ENST00000464858 633 ntTSL 316.29■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 314.06□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 313.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.186e-12■■■■□ 21.5
UTP18Q9Y5J1 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-12■■■■□ 21.5
UTP18Q9Y5J1 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 59.39□□□□□ -0.918e-11■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 328.59■■■□□ 2.173e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 325.76■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-207ENST00000531942 421 ntTSL 222.65■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 517.05■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216.88■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 213.87□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 49.49□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 48.91□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.022e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 26.57□□□□□ -1.362e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 21.3
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 221.72■■□□□ 1.076e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.598e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.08□□□□□ -0.478e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.75□□□□□ -0.538e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.58□□□□□ -1.28e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.22□□□□□ -1.258e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.68e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.668e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 28.18□□□□□ -1.11e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.67□□□□□ -1.181e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.32□□□□□ -1.241e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.25□□□□□ -1.571e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.06□□□□□ -1.61e-14■■■■□ 20.4
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