Protein–RNA interactions for Protein: Q12315

GLE1, Nucleoporin GLE1, yeastyeast

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GLE1Q12315 YMR103CYMR103C 363 nt8.72□□□□□ -1.01
GLE1Q12315 MAM3YOL060C 2121 nt8.72□□□□□ -1.01
GLE1Q12315 SPP2YOR148C 558 nt8.71□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 SEC61YLR378C 1443 nt8.71□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YPS3YLR121C 1527 nt8.7□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.7□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.7□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.7□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 VPS62YGR141W 1404 nt8.69□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 FLR1YBR008C 1647 nt8.69□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YDL086WYDL086W 822 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 SAM2YDR502C 1155 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 PAU5YFL020C 369 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 PRY1YJL079C 900 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 STP3YLR375W 1032 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 YNL190WYNL190W 615 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 ZAP1YJL056C 2643 nt8.68□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 VRG4YGL225W 1014 nt8.66□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 BET2YPR176C 978 nt8.66□□□□□ -1.02
GLE1Q12315 DLD2YDL178W 1593 nt8.65□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 YJL064WYJL064W 396 nt8.64□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 CCT5YJR064W 1689 nt8.64□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 DIG1YPL049C 1359 nt8.62□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 PHO23YNL097C 993 nt8.62□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 GNP1YDR508C 1992 nt8.62□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 YIL177CYIL177C 5277 nt8.62□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 QDR2YIL121W 1629 nt8.62□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 LAS17YOR181W 1902 nt8.61□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 PAU19YMR325W 375 nt8.61□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 NDE1YMR145C 1683 nt8.6□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 YJL055WYJL055W 738 nt8.6□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 NBA1YOL070C 1506 nt8.59□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 HEM13YDR044W 987 nt8.59□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 MSC1YML128C 1542 nt8.59□□□□□ -1.03
GLE1Q12315 YER188WYER188W 720 nt8.58□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 FRT1YOR324C 1809 nt8.58□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 TIM44YIL022W 1296 nt8.57□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 BNI5YNL166C 1347 nt8.56□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 FUB1YCR076C 753 nt8.55□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 PMA2YPL036W 2844 nt8.55□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 CSM1YCR086W 573 nt8.54□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 MIM1YOL026C 342 nt8.54□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 SLG1YOR008C 1137 nt8.54□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 YJR114WYJR114W 393 nt8.53□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 BEM1YBR200W 1656 nt8.53□□□□□ -1.04
GLE1Q12315 MAS1YLR163C 1389 nt8.52□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 GID8YMR135C 1368 nt8.52□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 ODC1YPL134C 933 nt8.52□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 SSL2YIL143C 2532 nt8.52□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 CWP2YKL096W-A 279 nt8.51□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 TAF13YML098W 504 nt8.51□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 OSH7YHR001W 1314 nt8.51□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 GAL3YDR009W 1563 nt8.49□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 GGC1YDL198C 903 nt8.49□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 HXT10YFL011W 1641 nt8.48□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 MRS6YOR370C 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 YJL118WYJL118W 660 nt8.47□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 ENT4YLL038C 744 nt8.47□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 YKL133CYKL133C 1392 nt8.47□□□□□ -1.05
GLE1Q12315 YHR219WYHR219W 1875 nt8.46□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 CCR4YAL021C 2514 nt8.46□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 CTF3YLR381W 2202 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 PAR32YDL173W 888 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 NUC1YJL208C 990 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 MDM35YKL053C-A 261 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 RIB1YBL033C 1038 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 YMR262WYMR262W 942 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 HBS1YKR084C 1836 nt8.45□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 AIM1YAL046C 357 nt8.44□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 DLD3YEL071W 1491 nt8.44□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 SNZ1YMR096W 894 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 TIP1YBR067C 633 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 RIB7YBR153W 735 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 RPT5YOR117W 1305 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 SAM3YPL274W 1764 nt8.43□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 YLR046CYLR046C 813 nt8.42□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 TAT2YOL020W 1779 nt8.42□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 DUS3YLR401C 2007 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 RAS2YNL098C 969 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 MHF1YOL086W-A 273 nt8.41□□□□□ -1.06
GLE1Q12315 YEL023CYEL023C 2049 nt8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms