Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 HOL1YNR055C 1761 nt9.5□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.5□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ERG13YML126C 1476 nt9.5□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ESS1YJR017C 513 nt9.49□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 RRT8YOL048C 1029 nt9.49□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 RFC1YOR217W 2586 nt9.49□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 AIM1YAL046C 357 nt9.48□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 MHF1YOL086W-A 273 nt9.48□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 BET2YPR176C 978 nt9.48□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 ARO8YGL202W 1503 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 TAF13YML098W 504 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 PGC1YPL206C 966 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 IML3YBR107C 738 nt9.47□□□□□ -0.89
SLX4Q12098 SAC7YDR389W 1965 nt9.45□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 YMR262WYMR262W 942 nt9.45□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 PAU5YFL020C 369 nt9.44□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.43□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 SPS100YHR139C 981 nt9.42□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 POT1YIL160C 1254 nt9.42□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 COQ8YGL119W 1506 nt9.41□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 QDR2YIL121W 1629 nt9.41□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 TOK1YJL093C 2076 nt9.41□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 YHL008CYHL008C 1884 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 DIG1YPL049C 1359 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 ADE8YDR408C 645 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 NIF3YGL221C 867 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 APS2YJR058C 444 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 YBR232CYBR232C 360 nt9.4□□□□□ -0.9
SLX4Q12098 KES1YPL145C 1305 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 OPI3YJR073C 621 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 ENT4YLL038C 744 nt9.38□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 ZAP1YJL056C 2643 nt9.37□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 TVP23YDR084C 600 nt9.37□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 STP3YLR375W 1032 nt9.37□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 TUB4YLR212C 1422 nt9.37□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 SGA1YIL099W 1650 nt9.36□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 HXK1YFR053C 1458 nt9.36□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 YJR114WYJR114W 393 nt9.36□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 GSF2YML048W 1212 nt9.36□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 PAB1YER165W 1734 nt9.36□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 YLR046CYLR046C 813 nt9.35□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 YMR209CYMR209C 1374 nt9.35□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 DLD3YEL071W 1491 nt9.34□□□□□ -0.91
SLX4Q12098 ITR2YOL103W 1830 nt9.33□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 YHR219WYHR219W 1875 nt9.33□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 GID8YMR135C 1368 nt9.33□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 MRS6YOR370C 1812 nt9.31□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 UGP1YKL035W 1500 nt9.31□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 GNP1YDR508C 1992 nt9.3□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 CDD1YLR245C 429 nt9.3□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 ABZ2YMR289W 1125 nt9.3□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 ALD5YER073W 1563 nt9.29□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 SEN2YLR105C 1134 nt9.29□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 YNR064CYNR064C 873 nt9.29□□□□□ -0.92
SLX4Q12098 NAS2YIL007C 663 nt9.27□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 YKL133CYKL133C 1392 nt9.26□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 ELO1YJL196C 933 nt9.26□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 NAS6YGR232W 687 nt9.25□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 LSR1LSR1 1175 nt9.25□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 SFL1YOR140W 2301 nt9.25□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 PAR32YDL173W 888 nt9.24□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 YJL064WYJL064W 396 nt9.23□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 SUV3YPL029W 2214 nt9.21□□□□□ -0.93
SLX4Q12098 IGD1YFR017C 588 nt9.2□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 HIS2YFR025C 1008 nt9.2□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 PCP1YGR101W 1041 nt9.2□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 SWT21YNL187W 1074 nt9.2□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 AMF1YOR378W 1548 nt9.2□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 KEL3YPL263C 1956 nt9.19□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 SSL2YIL143C 2532 nt9.19□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 PUP1YOR157C 786 nt9.19□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 MTO1YGL236C 2010 nt9.19□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 TPC1YGR096W 945 nt9.18□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 VMA11YPL234C 495 nt9.18□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 ENO2YHR174W 1314 nt9.17□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 PAU19YMR325W 375 nt9.17□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 THP3YPR045C 1413 nt9.16□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 NAP1YKR048C 1254 nt9.16□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 YMR265CYMR265C 1386 nt9.15□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 MET1YKR069W 1782 nt9.15□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 SPE2YOL052C 1191 nt9.15□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 TIP1YBR067C 633 nt9.15□□□□□ -0.94
SLX4Q12098 PSD1YNL169C 1503 nt9.15□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 RPD3YNL330C 1302 nt9.13□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 HAP5YOR358W 729 nt9.13□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 KRE1YNL322C 942 nt9.12□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 CRC1YOR100C 984 nt9.12□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 YKL053WYKL053W 375 nt9.11□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 CWP2YKL096W-A 279 nt9.11□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 SNX3YOR357C 489 nt9.11□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 ODC1YPL134C 933 nt9.11□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.1□□□□□ -0.95
SLX4Q12098 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms