Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 MDM35YKL053C-A 261 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 FMS1YMR020W 1527 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 LAS17YOR181W 1902 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 FLR1YBR008C 1647 nt7.09□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 SSL2YIL143C 2532 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 HXT12YIL170W 1374 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 ACH1YBL015W 1581 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 YPS3YLR121C 1527 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 YDL086WYDL086W 822 nt7.08□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 YJL055WYJL055W 738 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 YNR029CYNR029C 1290 nt7.07□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 HBS1YKR084C 1836 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 FUB1YCR076C 753 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 ADH1YOL086C 1047 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 GNP1YDR508C 1992 nt7.06□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 RIB2YOL066C 1776 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 RPT5YOR117W 1305 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 RAS2YNL098C 969 nt7.05□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 YJL118WYJL118W 660 nt7.04□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 DIG1YPL049C 1359 nt7.04□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 OSH7YHR001W 1314 nt7.03□□□□□ -1.28
ATG39Q06159 FRT1YOR324C 1809 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 MAS1YLR163C 1389 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 PMA2YPL036W 2844 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 SAM3YPL274W 1764 nt7.02□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 AGP3YFL055W 1677 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 YJL195CYJL195C 702 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 DUS3YLR401C 2007 nt7.01□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 HEM13YDR044W 987 nt7□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 OYE2YHR179W 1203 nt7□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 RIB7YBR153W 735 nt7□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 GID8YMR135C 1368 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 POP2YNR052C 1302 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 TPS1YBR126C 1488 nt6.98□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 NDE1YMR145C 1683 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 GAL3YDR009W 1563 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 EAF3YPR023C 1206 nt6.97□□□□□ -1.29
ATG39Q06159 SOL2YCR073W-A 948 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 FUN14YAL008W 597 nt6.96□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.95□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 GGC1YDL198C 903 nt6.94□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YKL133CYKL133C 1392 nt6.94□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 MRS6YOR370C 1812 nt6.93□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 CWP2YKL096W-A 279 nt6.93□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 LSR1LSR1 1175 nt6.93□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 GPN2YOR262W 1044 nt6.93□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 LSM5YER146W 282 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 ASP3-1YLR155C 1089 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 ASP3-2YLR157C 1089 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 ASP3-3YLR158C 1089 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 ASP3-4YLR160C 1089 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 TAT2YOL020W 1779 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.92□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 ADE16YLR028C 1776 nt6.91□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 BEM1YBR200W 1656 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 YEL008WYEL008W 381 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 DDI1YER143W 1287 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 TMA23YMR269W 636 nt6.9□□□□□ -1.3
ATG39Q06159 AIM1YAL046C 357 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 AIM34YMR003W 597 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 YHR219WYHR219W 1875 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 CTF3YLR381W 2202 nt6.89□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 CCT5YJR064W 1689 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 YDR455CYDR455C 309 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 ENT4YLL038C 744 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 STE4YOR212W 1272 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 YEL023CYEL023C 2049 nt6.88□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 FET5YFL041W 1869 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 CCR4YAL021C 2514 nt6.87□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 TOP3YLR234W 1971 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 ORT1YOR130C 879 nt6.86□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 DLD3YEL071W 1491 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 RPD3YNL330C 1302 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 YLR046CYLR046C 813 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 SNZ1YMR096W 894 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 ERG13YML126C 1476 nt6.85□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 AFG2YLR397C 2343 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 IMO32YGR031W 1029 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 TIM44YIL022W 1296 nt6.84□□□□□ -1.31
ATG39Q06159 PFS2YNL317W 1398 nt6.83□□□□□ -1.32
ATG39Q06159 YLR349WYLR349W 507 nt6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50 ms