Protein–RNA interactions for Protein: P39928

SLN1, Osmosensing histidine protein kinase SLN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLN1P39928 THI72YOR192C 1800 nt10.47□□□□□ -0.73
SLN1P39928 AIM1YAL046C 357 nt10.46□□□□□ -0.73
SLN1P39928 TAF13YML098W 504 nt10.46□□□□□ -0.73
SLN1P39928 SNZ1YMR096W 894 nt10.45□□□□□ -0.74
SLN1P39928 EAF3YPR023C 1206 nt10.45□□□□□ -0.74
SLN1P39928 PGC1YPL206C 966 nt10.44□□□□□ -0.74
SLN1P39928 DLD3YEL071W 1491 nt10.43□□□□□ -0.74
SLN1P39928 PAU5YFL020C 369 nt10.42□□□□□ -0.74
SLN1P39928 YPR126CYPR126C 309 nt10.42□□□□□ -0.74
SLN1P39928 OSH7YHR001W 1314 nt10.41□□□□□ -0.74
SLN1P39928 STP3YLR375W 1032 nt10.41□□□□□ -0.74
SLN1P39928 ARO7YPR060C 771 nt10.41□□□□□ -0.74
SLN1P39928 ALD5YER073W 1563 nt10.4□□□□□ -0.74
SLN1P39928 DAK2YFL053W 1776 nt10.4□□□□□ -0.74
SLN1P39928 CWP2YKL096W-A 279 nt10.4□□□□□ -0.74
SLN1P39928 YBR232CYBR232C 360 nt10.4□□□□□ -0.74
SLN1P39928 HXK1YFR053C 1458 nt10.39□□□□□ -0.75
SLN1P39928 MHF1YOL086W-A 273 nt10.39□□□□□ -0.75
SLN1P39928 ITR2YOL103W 1830 nt10.37□□□□□ -0.75
SLN1P39928 URA8YJR103W 1737 nt10.37□□□□□ -0.75
SLN1P39928 SEN2YLR105C 1134 nt10.37□□□□□ -0.75
SLN1P39928 YLR046CYLR046C 813 nt10.36□□□□□ -0.75
SLN1P39928 TMA23YMR269W 636 nt10.36□□□□□ -0.75
SLN1P39928 AGP3YFL055W 1677 nt10.36□□□□□ -0.75
SLN1P39928 TIM44YIL022W 1296 nt10.35□□□□□ -0.75
SLN1P39928 IML3YBR107C 738 nt10.35□□□□□ -0.75
SLN1P39928 RPD3YNL330C 1302 nt10.34□□□□□ -0.75
SLN1P39928 CTI6YPL181W 1521 nt10.34□□□□□ -0.75
SLN1P39928 SOL2YCR073W-A 948 nt10.34□□□□□ -0.75
SLN1P39928 YDR455CYDR455C 309 nt10.34□□□□□ -0.75
SLN1P39928 YMR262WYMR262W 942 nt10.34□□□□□ -0.75
SLN1P39928 POT1YIL160C 1254 nt10.33□□□□□ -0.76
SLN1P39928 NAP1YKR048C 1254 nt10.33□□□□□ -0.76
SLN1P39928 DDI1YER143W 1287 nt10.31□□□□□ -0.76
SLN1P39928 IMO32YGR031W 1029 nt10.3□□□□□ -0.76
SLN1P39928 GSF2YML048W 1212 nt10.3□□□□□ -0.76
SLN1P39928 LSM5YER146W 282 nt10.29□□□□□ -0.76
SLN1P39928 PAM17YKR065C 594 nt10.27□□□□□ -0.77
SLN1P39928 NBA1YOL070C 1506 nt10.27□□□□□ -0.77
SLN1P39928 DPL1YDR294C 1770 nt10.26□□□□□ -0.77
SLN1P39928 TUB4YLR212C 1422 nt10.26□□□□□ -0.77
SLN1P39928 YOR072WYOR072W 315 nt10.26□□□□□ -0.77
SLN1P39928 PCP1YGR101W 1041 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 PUP1YOR157C 786 nt10.25□□□□□ -0.77
SLN1P39928 PAR32YDL173W 888 nt10.24□□□□□ -0.77
SLN1P39928 ENT4YLL038C 744 nt10.24□□□□□ -0.77
SLN1P39928 RRT8YOL048C 1029 nt10.24□□□□□ -0.77
SLN1P39928 RIM2YBR192W 1134 nt10.24□□□□□ -0.77
SLN1P39928 YJL064WYJL064W 396 nt10.23□□□□□ -0.77
SLN1P39928 RPC31YNL151C 756 nt10.23□□□□□ -0.77
SLN1P39928 VMA11YPL234C 495 nt10.22□□□□□ -0.77
SLN1P39928 NIF3YGL221C 867 nt10.21□□□□□ -0.77
SLN1P39928 SPS100YHR139C 981 nt10.21□□□□□ -0.77
SLN1P39928 APS2YJR058C 444 nt10.21□□□□□ -0.77
SLN1P39928 TIP1YBR067C 633 nt10.21□□□□□ -0.77
SLN1P39928 LEU4YNL104C 1860 nt10.2□□□□□ -0.78
SLN1P39928 MEX67YPL169C 1800 nt10.2□□□□□ -0.78
SLN1P39928 FET5YFL041W 1869 nt10.19□□□□□ -0.78
SLN1P39928 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.19□□□□□ -0.78
SLN1P39928 PAU19YMR325W 375 nt10.19□□□□□ -0.78
SLN1P39928 SAC7YDR389W 1965 nt10.18□□□□□ -0.78
SLN1P39928 SNX3YOR357C 489 nt10.17□□□□□ -0.78
SLN1P39928 ERG13YML126C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
SLN1P39928 ADE8YDR408C 645 nt10.15□□□□□ -0.78
SLN1P39928 REG2YBR050C 1017 nt10.15□□□□□ -0.78
SLN1P39928 VAR1Q0140 1197 nt10.14□□□□□ -0.79
SLN1P39928 NPP2YEL016C 1482 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt10.13□□□□□ -0.79
SLN1P39928 MDL2YPL270W 2322 nt10.12□□□□□ -0.79
SLN1P39928 TVP23YDR084C 600 nt10.12□□□□□ -0.79
SLN1P39928 YJR114WYJR114W 393 nt10.1□□□□□ -0.79
SLN1P39928 YDR509WYDR509W 348 nt10.09□□□□□ -0.79
SLN1P39928 ELO1YJL196C 933 nt10.08□□□□□ -0.8
SLN1P39928 ABZ2YMR289W 1125 nt10.08□□□□□ -0.8
SLN1P39928 INH1YDL181W 258 nt10.07□□□□□ -0.8
SLN1P39928 IGD1YFR017C 588 nt10.07□□□□□ -0.8
SLN1P39928 MIM1YOL026C 342 nt10.07□□□□□ -0.8
SLN1P39928 OPI3YJR073C 621 nt10.06□□□□□ -0.8
SLN1P39928 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.04□□□□□ -0.8
SLN1P39928 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.04□□□□□ -0.8
SLN1P39928 SLG1YOR008C 1137 nt10.04□□□□□ -0.8
SLN1P39928 TRP2YER090W 1524 nt10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.5 ms