Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms