Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms