Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YPL034WYPL034W 498 nt2.34□□□□□ -2.03
MDE1P47095 SIR4YDR227W 4077 nt2.34□□□□□ -2.04
MDE1P47095 MSL5YLR116W 1431 nt2.34□□□□□ -2.04
MDE1P47095 BI4Q0120 1917 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RVS161YCR009C 798 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YDR199WYDR199W 366 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 TIF35YDR429C 825 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YGL015CYGL015C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SPO13YHR014W 876 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YKL044WYKL044W 321 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YKL066WYKL066W 444 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 HRI1YLR301W 735 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RPS17AYML024W 411 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 HHT2YNL031C 411 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YOL150CYOL150C 312 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 OST2YOR103C 393 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 VAC8YEL013W 1737 nt2.33□□□□□ -2.04
MDE1P47095 OSW7YFR039C 1533 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 LEU3YLR451W 2661 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SNF12YNR023W 1701 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YCR001WYCR001W 315 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RPL9AYGL147C 576 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RUF22RUF22 515 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 NUP170YBL079W 4509 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 IST2YBR086C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
MDE1P47095 ARP8YOR141C 2646 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 HNT1YDL125C 477 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 FYV4YHR059W 393 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YJR157WYJR157W 363 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 LSM2YBL026W 288 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SWM2YNR004W 441 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SVS1YPL163C 783 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 DAD3YBR233W-A 285 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 VPS13YLL040C 9435 nt2.31□□□□□ -2.04
MDE1P47095 PDR11YIL013C 4236 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 snR70snR70 164 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 TIM10YHR005C-A 282 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YHC1YLR298C 696 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YLR379WYLR379W 375 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 TOA1YOR194C 861 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 ARR2YPR200C 393 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YBR209WYBR209W 318 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SSF2YDR312W 1362 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 PSO2YMR137C 1986 nt2.3□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YDR250CYDR250C 276 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 GPI15YNL038W 690 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SPC29YPL124W 762 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RSA1YPL193W 1146 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 BUB1YGR188C 3066 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RRP6YOR001W 2202 nt2.29□□□□□ -2.04
MDE1P47095 RPL16AYIL133C 600 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 BET3YKR068C 582 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 ARV1YLR242C 966 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 ATX2YOR079C 942 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 PDR3YBL005W 2931 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 YPP1YGR198W 2454 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SVL3YPL032C 2478 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 SAP185YJL098W 3177 nt2.28□□□□□ -2.04
MDE1P47095 CLN3YAL040C 1743 nt2.28□□□□□ -2.05
MDE1P47095 AYT1YLL063C 1425 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 ECM25YJL201W 1800 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 COX13YGL191W 390 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 VTI1YMR197C 654 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YOR050CYOR050C 348 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 ALG14YBR070C 714 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YBR277CYBR277C 402 nt2.27□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RTT101YJL047C 2529 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 NOP14YDL148C 2433 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 COS111YBR203W 2775 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YFR056CYFR056C 369 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RAD6YGL058W 519 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 PEX4YGR133W 552 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YAP3YHL009C 993 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 PBI2YNL015W 228 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 TRM7YBR061C 933 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 TOF1YNL273W 3717 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 ASM4YDL088C 1587 nt2.26□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 SYM1YLR251W 594 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 NSL1YPL233W 651 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YPR177CYPR177C 372 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 SCD5YOR329C 2619 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 DNF1YER166W 4716 nt2.25□□□□□ -2.05
MDE1P47095 NEW1YPL226W 3591 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 VPH1YOR270C 2523 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RPL29YFR032C-A 180 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.24□□□□□ -2.05
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