Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YDR133CYDR133C 336 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPL14BYHL001W 417 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 LAG1YHL003C 1236 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YKL118WYKL118W 312 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PAU23YLR037C 375 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPL20AYMR242C 519 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YAF9YNL107W 681 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YPL080CYPL080C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 AYT1YLL063C 1425 nt2.39□□□□□ -2.03
AVT5P38176 HEH2YDR458C 1992 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 APC11YDL008W 498 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PAU10YDR542W 363 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PAU11YGL261C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PAU4YLR461W 363 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 UBC7YMR022W 498 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 ERP4YOR016C 624 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 NIC96YFR002W 2520 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YDR239CYDR239C 2364 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PSY2YNL201C 2577 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YOL057WYOL057W 2136 nt2.38□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YDL152WYDL152W 366 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 NHP2YDL208W 471 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YGR025WYGR025W 303 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 SIP18YMR175W 240 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 snR191snR191 274 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 GNT1YOR320C 1476 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 MSB2YGR014W 3921 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 MES1YGR264C 2256 nt2.37□□□□□ -2.03
AVT5P38176 ERG28YER044C 447 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPL8BYLL045C 771 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 ICY1YMR195W 384 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 PEX17YNL214W 600 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 snR13snR13 124 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 DGK1YOR311C 873 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 GYP7YDL234C 2241 nt2.36□□□□□ -2.03
AVT5P38176 TIM11YDR322C-A 291 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 IRC4YDR540C 540 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YHL037CYHL037C 402 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 FYV4YHR059W 393 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YBL108WYBL108W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 NSL1YPL233W 651 nt2.35□□□□□ -2.03
AVT5P38176 CYR1YJL005W 6081 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 TAF2YCR042C 4224 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 KEL2YGR238C 2649 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPL29YFR032C-A 180 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 RPC10YHR143W-A 213 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 MRPL50YNR022C 420 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 YOR282WYOR282W 321 nt2.34□□□□□ -2.03
AVT5P38176 ROG1YGL144C 2058 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YDR413CYDR413C 576 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SDC1YDR469W 528 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 NOP19YGR251W 591 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YJR023CYJR023C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 PET191YJR034W 327 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 RPL37AYLR185W 267 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YAR068WYAR068W 486 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 VTI1YMR197C 654 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 MKT1YNL085W 2493 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SNF12YNR023W 1701 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SGM1YJR134C 2124 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 TRZ1YKR079C 2517 nt2.33□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YDL068WYDL068W 330 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 MAM33YIL070C 801 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YKL111CYKL111C 336 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 URA10YMR271C 684 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YPR039WYPR039W 336 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 TLC1TLC1 1301 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YIL169CYIL169C 2988 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 TRM2YKR056W 1920 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SWT1YOR166C 1377 nt2.32□□□□□ -2.04
AVT5P38176 MET6YER091C 2304 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SNX41YDR425W 1878 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 MRD1YPR112C 2664 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 AXL1YPR122W 3627 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 AST2YER101C 1293 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YAR053WYAR053W 297 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SMA2YML066C 1110 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 YPL276WYPL276W 438 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 SLM6YBR266C 453 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 MLH1YMR167W 2310 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 FUS1YCL027W 1539 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 CSF1YLR087C 8877 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 DIE2YGR227W 1578 nt2.31□□□□□ -2.04
AVT5P38176 ILS1YBL076C 3219 nt2.3□□□□□ -2.04
AVT5P38176 DPB11YJL090C 2295 nt2.3□□□□□ -2.04
AVT5P38176 APC2YLR127C 2562 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.6 ms