Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPREB3Q9UKI3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VPREB3Q9UKI3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms