Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXD3Q9UJU5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXD3Q9UJU5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms