Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP33Q8TEY7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
USP33Q8TEY7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms