Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC93Q567U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC93Q567U6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms