Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME3Q16798 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ME3Q16798 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ME3Q16798 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ME3Q16798 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ME3Q16798 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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