Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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