Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 RSF2YJR127C 4143 nt3.69□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 MYO5YMR109W 3660 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 SIP3YNL257C 3690 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YHR078WYHR078W 1659 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 NSP1YJL041W 2472 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 APC11YDL008W 498 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YDR250CYDR250C 276 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 HMF1YER057C 390 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YLR031WYLR031W 561 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 RPL9BYNL067W 576 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 SWH1YAR042W 3567 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.68□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 RAD26YJR035W 3258 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YIL058WYIL058W 285 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 IRC23YOR044W 474 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 NPR1YNL183C 2373 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 SPP382YLR424W 2127 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 TPS2YDR074W 2691 nt3.67□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 STE14YDR410C 720 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 NCE101YJL205C 162 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 COX7YMR256C 183 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YBL073WYBL073W 312 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 RPS7AYOR096W 573 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 SET1YHR119W 3243 nt3.66□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 STU1YBL034C 4542 nt3.65□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YBP1YBR216C 2025 nt3.65□□□□□ -1.82
MCD1Q12158 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 ESF2YNR054C 951 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 ATP15YPL271W 189 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 CHD1YER164W 4407 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 ECM5YMR176W 4236 nt3.65□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 ZDS1YMR273C 2748 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 RAD5YLR032W 3510 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 RDS1YCR106W 2499 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 AAD3YCR107W 1092 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 IMP4YNL075W 873 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YJL016WYJL016W 1686 nt3.64□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 RPS17BYDR447C 411 nt3.63□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 GCN4YEL009C 846 nt3.63□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 NUP82YJL061W 2142 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 COG3YER157W 2406 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 GYP7YDL234C 2241 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 SOD1YJR104C 465 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 COX19YLL018C-A 297 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YPL229WYPL229W 621 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 VPS52YDR484W 1926 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 CDC45YLR103C 1953 nt3.62□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YPK1YKL126W 2043 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 LEU3YLR451W 2661 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YLR352WYLR352W 2424 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 PCF11YDR228C 1881 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 SPG3YDR504C 384 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YMR31YFR049W 372 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 TMA22YJR014W 597 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 TMA19YKL056C 504 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 SPT6YGR116W 4356 nt3.61□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YDL041WYDL041W 354 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YFL063WYFL063W 456 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 MDV1YJL112W 2145 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 FCF2YLR051C 654 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 RPL26AYLR344W 384 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 RPL20BYOR312C 519 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 TOM70YNL121C 1854 nt3.6□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 DIA2YOR080W 2199 nt3.59□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 NOT5YPR072W 1683 nt3.59□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YAR070CYAR070C 300 nt3.59□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 ISF1YMR081C 1017 nt3.59□□□□□ -1.83
MCD1Q12158 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YCL019WYCL019W 5313 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 BRO1YPL084W 2535 nt3.59□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 PRP22YER013W 3438 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 SLA1YBL007C 3735 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 HYR1YIR037W 492 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 UTP30YKR060W 825 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 MDN1YLR106C 14733 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YJL181WYJL181W 1836 nt3.58□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YDL011CYDL011C 324 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 RPL30YGL030W 318 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 PSY1YKL076C 384 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 GPI13YLL031C 3054 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 FUS1YCL027W 1539 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 BOI1YBL085W 2943 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 SIZ1YDR409W 2715 nt3.57□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 VPS53YJL029C 2469 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 NOP4YPL043W 2058 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 DAN4YJR151C 3486 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YPR022CYPR022C 3402 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 WIP1YDR374W-A 270 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 SPT4YGR063C 309 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 MSS11YMR164C 2277 nt3.56□□□□□ -1.84
MCD1Q12158 NAN1YPL126W 2691 nt3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.3 ms