Protein–RNA interactions for Protein: P61129

ZC3H6, Zinc finger CCCH domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H6P61129 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZC3H6P61129 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZC3H6P61129 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms