Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 PRM8YGL053W 714 nt2.72□□□□□ -1.97
HEF3P53978 EAF6YJR082C 342 nt2.72□□□□□ -1.97
HEF3P53978 VID24YBR105C 1089 nt2.72□□□□□ -1.97
HEF3P53978 INP53YOR109W 3324 nt2.71□□□□□ -1.97
HEF3P53978 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.71□□□□□ -1.97
HEF3P53978 CWC22YGR278W 1734 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YDL009CYDL009C 324 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 BAT1YHR208W 1182 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 ATP7YKL016C 525 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 NYV1YLR093C 762 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 RPS22BYLR367W 393 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 KTI11YBL071W-A 249 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YPR014CYPR014C 330 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YPR096CYPR096C 303 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SIP3YNL257C 3690 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SNX41YDR425W 1878 nt2.71□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YCR108CYCR108C 192 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YDR220CYDR220C 294 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 MRP49YKL167C 414 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 PHO80YOL001W 882 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 ATP19YOL077W-A 207 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 OST2YOR103C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 snR191snR191 274 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SSN2YDR443C 4263 nt2.7□□□□□ -1.98
HEF3P53978 BFR1YOR198C 1413 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 DFG10YIL049W 762 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 AFB1YLR040C 675 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YNL122CYNL122C 348 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 ISU1YPL135W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SSF1YHR066W 1362 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 IRC8YJL051W 2469 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 TAE2YPL009C 3117 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 PHR1YOR386W 1698 nt2.69□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SEN54YPL083C 1404 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 GEA1YJR031C 4227 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SAP185YJL098W 3177 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 TCD1YHR003C 1290 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 PET123YOR158W 957 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SNU56YDR240C 1479 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 TRZ1YKR079C 2517 nt2.68□□□□□ -1.98
HEF3P53978 PUT3YKL015W 2940 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YGL042CYGL042C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SPO13YHR014W 876 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 HRI1YLR301W 735 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 DGR1YNL130C-A 147 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 BI4Q0120 1917 nt2.67□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YOL057WYOL057W 2136 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SSY1YDR160W 2559 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 HNT1YDL125C 477 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YDR199WYDR199W 366 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YGL015CYGL015C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 OTU2YHL013C 924 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YNL179CYNL179C 438 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 PEX17YNL214W 600 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 YOL150CYOL150C 312 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 HSP10YOR020C 321 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 TOA1YOR194C 861 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 RRG8YPR116W 834 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 SUL1YBR294W 2580 nt2.66□□□□□ -1.98
HEF3P53978 RAV1YJR033C 4074 nt2.65□□□□□ -1.98
HEF3P53978 FPR1YNL135C 345 nt2.65□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SSD1YDR293C 3753 nt2.65□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SSQ1YLR369W 1974 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YGR045CYGR045C 363 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 FYV7YLR068W 456 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YLR302CYLR302C 363 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 MRPL44YMR225C 297 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 HHT2YNL031C 411 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RIO2YNL207W 1278 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YPL034WYPL034W 498 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SVS1YPL163C 783 nt2.64□□□□□ -1.99
HEF3P53978 SSF2YDR312W 1362 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 GDI1YER136W 1356 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YDR239CYDR239C 2364 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RGL1YPL066W 1440 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 AHC2YCR082W 387 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 TIM11YDR322C-A 291 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 HYP2YEL034W 474 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 CAJ1YER048C 1176 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RPL9AYGL147C 576 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 UBP15YMR304W 3693 nt2.63□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RVS161YCR009C 798 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 DAD4YDR320C-A 219 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 YMR31YFR049W 372 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 VAR1Q0140 1197 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 TIM10YHR005C-A 282 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 RPF1YHR088W 888 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 GUP1YGL084C 1683 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 COG3YER157W 2406 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 FUS1YCL027W 1539 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 HRD3YLR207W 2502 nt2.62□□□□□ -1.99
HEF3P53978 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
HEF3P53978 ISW1YBR245C 3390 nt2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.6 ms