Protein–RNA interactions for Protein: P45818

ROK1, ATP-dependent RNA helicase ROK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROK1P45818 YOR248WYOR248W 303 nt2.79□□□□□ -1.96
ROK1P45818 SVS1YPL163C 783 nt2.79□□□□□ -1.96
ROK1P45818 TRZ1YKR079C 2517 nt2.79□□□□□ -1.96
ROK1P45818 SHE4YOR035C 2370 nt2.79□□□□□ -1.96
ROK1P45818 SIP3YNL257C 3690 nt2.79□□□□□ -1.96
ROK1P45818 ATG13YPR185W 2217 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 SWF1YDR126W 1011 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 HPA3YEL066W 540 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 YNL146WYNL146W 303 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 YPL034WYPL034W 498 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 UBP15YMR304W 3693 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 MSB2YGR014W 3921 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 GEA1YJR031C 4227 nt2.78□□□□□ -1.96
ROK1P45818 COG3YER157W 2406 nt2.78□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YER138CYER138C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YER160CYER160C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YJR027WYJR027W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YML039WYML039W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YML045WYML045W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YMR050CYMR050C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 TFC4YGR047C 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 DUG2YBR281C 2637 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 ISW1YBR245C 3390 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 KIN82YCR091W 2163 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YER135CYER135C 393 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YMR31YFR049W 372 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 PRE8YML092C 753 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 HSP10YOR020C 321 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPL185WYPL185W 396 nt2.77□□□□□ -1.97
ROK1P45818 TRS130YMR218C 3309 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPL216WYPL216W 3309 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 IKI3YLR384C 4050 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YGR067CYGR067C 2415 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR537CYDR537C 606 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RPS26BYER131W 360 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 ECL1YGR146C 636 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 CRG1YHR209W 876 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 BET3YKR068C 582 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YLR101CYLR101C 396 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPR096CYPR096C 303 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YKR078WYKR078W 1758 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YHR078WYHR078W 1659 nt2.76□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YDR239CYDR239C 2364 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 NPR1YNL183C 2373 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 POM152YMR129W 4014 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 ERV1YGR029W 570 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 SPC1YJR010C-A 285 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RNP1YLL046C 750 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 JIP3YLR331C 378 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 ESF2YNR054C 951 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 VID24YBR105C 1089 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 VAC8YEL013W 1737 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 VPS64YDR200C 1815 nt2.75□□□□□ -1.97
ROK1P45818 FLO11YIR019C 4104 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RTS3YGR161C 792 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 AFB1YLR040C 675 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 PEP12YOR036W 867 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YBR285WYBR285W 435 nt2.74□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RLF2YPR018W 1821 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 SAP1YER047C 2694 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YCR064CYCR064C 411 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YLR287CYLR287C 1068 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YML108WYML108W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RRI2YOL117W 1938 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YPL150WYPL150W 2706 nt2.73□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YBT1YLL048C 4986 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 GCV2YMR189W 3105 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 IRC2YDR112W 309 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 SSN2YDR443C 4263 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 FIR1YER032W 2631 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 YOL150CYOL150C 312 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 OST2YOR103C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 DNL4YOR005C 2835 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 TCB2YNL087W 3537 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 RSE1YML049C 4086 nt2.72□□□□□ -1.97
ROK1P45818 PUF4YGL014W 2667 nt2.71□□□□□ -1.98
ROK1P45818 HNT1YDL125C 477 nt2.71□□□□□ -1.98
ROK1P45818 RPS20YHL015W 366 nt2.71□□□□□ -1.98
ROK1P45818 YIL174WYIL174W 228 nt2.71□□□□□ -1.98
ROK1P45818 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.71□□□□□ -1.98
ROK1P45818 PAU23YLR037C 375 nt2.71□□□□□ -1.98
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