Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF2E1P29083 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E1P29083 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms