Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 SLP1YOR154W 1764 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 USA1YML029W 2517 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 NOG1YPL093W 1944 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SNX41YDR425W 1878 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 OSH6YKR003W 1347 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 TAF1YGR274C 3201 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 BAR1YIL015W 1764 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YDR250CYDR250C 276 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 FRQ1YDR373W 573 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 PRE8YML092C 753 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 IRC23YOR044W 474 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YPL238CYPL238C 390 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 CWC22YGR278W 1734 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SAF1YBR280C 1914 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 LCB5YLR260W 2064 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 FOX2YKR009C 2703 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YBP1YBR216C 2025 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 ALA1YOR335C 2877 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 MDM32YOR147W 1869 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 WIP1YDR374W-A 270 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 TVP18YMR071C 504 nt3.25□□□□□ -1.89
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TRM13Q12383 YPL229WYPL229W 621 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YPR099CYPR099C 357 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SSM4YIL030C 3960 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 CCT7YJL111W 1653 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 snR80snR80 171 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 STE14YDR410C 720 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YFL063WYFL063W 456 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 RPL30YGL030W 318 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SPT4YGR063C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 BCD1YHR040W 1101 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 RPC10YHR143W-A 213 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 ECM15YBL001C 315 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 DPB11YJL090C 2295 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 KIN2YLR096W 3444 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YGR237CYGR237C 2358 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SMT3YDR510W 306 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 AIM11YER093C-A 414 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YGL149WYGL149W 306 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YNL198CYNL198C 303 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 HHF1YBR009C 312 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 ARO80YDR421W 2853 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YLR352WYLR352W 2424 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 TRS120YDR407C 3870 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 URM1YIL008W 300 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SHH3YMR118C 591 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 CWH43YCR017C 2862 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 IRC10YOL015W 1761 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 ROD1YOR018W 2514 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 SYT1YPR095C 3681 nt3.22□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 MTR4YJL050W 3222 nt3.21□□□□□ -1.89
TRM13Q12383 ZDS2YML109W 2829 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 KIN4YOR233W 2403 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 SOD1YJR104C 465 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 FAA2YER015W 2235 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 RSF2YJR127C 4143 nt3.21□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 RNR1YER070W 2667 nt3.21□□□□□ -1.9
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TRM13Q12383 ARG2YJL071W 1725 nt3.2□□□□□ -1.9
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TRM13Q12383 YLR416CYLR416C 399 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YDL176WYDL176W 2127 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 NMA111YNL123W 2994 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 TOP1YOL006C 2310 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 MUS81YDR386W 1899 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 MDN1YLR106C 14733 nt3.2□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 DNM1YLL001W 2274 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 CCM1YGR150C 2595 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 ATP25YMR098C 1839 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 CDC36YDL165W 576 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YBL073WYBL073W 312 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 ISU1YPL135W 498 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 CDC45YLR103C 1953 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 URB2YJR041C 3525 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 NUP60YAR002W 1620 nt3.19□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 FAP7YDL166C 594 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 ADK1YDR226W 669 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 HEM4YOR278W 828 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 ARK1YNL020C 1917 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 PCF11YDR228C 1881 nt3.18□□□□□ -1.9
TRM13Q12383 AIP1YMR092C 1848 nt3.17□□□□□ -1.9
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