Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 HEM4YOR278W 828 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YPL039WYPL039W 951 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 ATP22YDR350C 2055 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 CHS2YBR038W 2892 nt3.26□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 STE23YLR389C 3084 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 SHQ1YIL104C 1524 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 SIP18YMR175W 240 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YBL065WYBL065W 345 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 SWD3YBR175W 948 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 DUF1YOL087C 3351 nt3.25□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 SDH7YDR511W 402 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 LAG1YHL003C 1236 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 ERP4YOR016C 624 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YPL185WYPL185W 396 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 TSC3YBR058C-A 243 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 TIM12YBR091C 330 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YSY6YBR162W-A 198 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YMR317WYMR317W 3423 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 AI2Q0055 2565 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 FLO5YHR211W 3228 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 TOM70YNL121C 1854 nt3.24□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR001CYLR001C 2589 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 NET1YJL076W 3570 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RRT13YER066W 558 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RAD6YGL058W 519 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RTT102YGR275W 474 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 YLR434CYLR434C 384 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 CHO2YGR157W 2610 nt3.23□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 SPO71YDR104C 3738 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 MET10YFR030W 3108 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 VOA1YGR106C 798 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 IMP4YNL075W 873 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RPB11YOL005C 363 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 RPN1YHR027C 2982 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 CWC22YGR278W 1734 nt3.22□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 NMA111YNL123W 2994 nt3.21□□□□□ -1.89
VHS3Q08438 KIN82YCR091W 2163 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 BFR1YOR198C 1413 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 TRZ1YKR079C 2517 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 VHR2YER064C 1518 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YDR090CYDR090C 933 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RPS24BYIL069C 408 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 ZEO1YOL109W 342 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 DGK1YOR311C 873 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 BIT61YJL058C 1632 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RPA190YOR341W 4995 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 SNF12YNR023W 1701 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 DPB11YJL090C 2295 nt3.21□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RPL40BYKR094C 387 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YAR068WYAR068W 486 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 UNG1YML021C 1080 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YNL043CYNL043C 321 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 ISU1YPL135W 498 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 TFB1YDR311W 1929 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MMS1YPR164W 4224 nt3.2□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 STE6YKL209C 3873 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 LRG1YDL240W 3054 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 SOK1YDR006C 2706 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 TIF35YDR429C 825 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 PHD1YKL043W 1101 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 UBC7YMR022W 498 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RPL20BYOR312C 519 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YOR385WYOR385W 873 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 ROY1YMR258C 1662 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MDM32YOR147W 1869 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 TOM1YDR457W 9807 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MSL5YLR116W 1431 nt3.19□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YKL100CYKL100C 1764 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 GNT1YOR320C 1476 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MAK21YDR060W 3078 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YGR025WYGR025W 303 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 COX23YHR116W 456 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 YJR023CYJR023C 402 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 BPT1YLL015W 4680 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RPL37AYLR185W 267 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 URA10YMR271C 684 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 snR13snR13 124 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 snR191snR191 274 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 SLM6YBR266C 453 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 RRM3YHR031C 2172 nt3.18□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 ERG28YER044C 447 nt3.17□□□□□ -1.9
VHS3Q08438 MRPL50YNR022C 420 nt3.17□□□□□ -1.9
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