Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YNL034WYNL034W 1839 nt2.47□□□□□ -2.01
CIK1Q01649 EDS1YBR033W 2760 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YPK1YKL126W 2043 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 NEW1YPL226W 3591 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 VPS74YDR372C 1038 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PAU8YAL068C 363 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PDP3YLR455W 915 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PAU20YOL161C 363 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ARP8YOR141C 2646 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 NUP100YKL068W 2880 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 DBP10YDL031W 2988 nt2.46□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YEL043WYEL043W 2871 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 KSP1YHR082C 3090 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SDL1YIL167W 633 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SRP21YKL122C 504 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YMR144WYMR144W 1029 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SWM2YNR004W 441 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 VPS16YPL045W 2397 nt2.45□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SAK1YER129W 3429 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 OSW7YFR039C 1533 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 TIM9YEL020W-A 264 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 GPI14YJR013W 1212 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 BET3YKR068C 582 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 NBP1YLR457C 960 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 RPL25YOL127W 429 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 OST2YOR103C 393 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SRL4YPL033C 846 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YPL034WYPL034W 498 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PRK1YIL095W 2433 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SVL3YPL032C 2478 nt2.44□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ASG1YIL130W 2895 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SNX41YDR425W 1878 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 RPO41YFL036W 4056 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ECM25YJL201W 1800 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 IRC2YDR112W 309 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YGL042CYGL042C 306 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YJL119CYJL119C 324 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 VPS51YKR020W 495 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PRE8YML092C 753 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PEX17YNL214W 600 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YOR331CYOR331C 558 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 TAZ1YPR140W 1146 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YBR277CYBR277C 402 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ORC1YML065W 2745 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 UBP15YMR304W 3693 nt2.43□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PES4YFR023W 1836 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 snR5snR5 204 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 MRP10YDL045W-A 288 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YFH1YDL120W 525 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YDR199WYDR199W 366 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 HHT2YNL031C 411 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YNL150WYNL150W 408 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 GIM3YNL153C 390 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 VMA9YCL005W-A 222 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YOL098CYOL098C 3114 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 VPS13YLL040C 9435 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ECM5YMR176W 4236 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YEF3YLR249W 3135 nt2.42□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 UBR1YGR184C 5853 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SNU114YKL173W 3027 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 CSF1YLR087C 8877 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SEC26YDR238C 2922 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 TSA2YDR453C 591 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YDR537CYDR537C 606 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ERP6YGL002W 651 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YGL165CYGL165C 579 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 COG2YGR120C 789 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 PRS3YHL011C 963 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 ECM9YKR004C 1134 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 UTP30YKR060W 825 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 RPS17AYML024W 411 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 TAP42YMR028W 1101 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SSE1YPL106C 2082 nt2.41□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 SSF2YDR312W 1362 nt2.4□□□□□ -2.02
CIK1Q01649 YDL009CYDL009C 324 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 GPI8YDR331W 1236 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YHR054CYHR054C 1065 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 TOF1YNL273W 3717 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 GIS1YDR096W 2685 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 STD1YOR047C 1335 nt2.4□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YDR186CYDR186C 2634 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YPR097WYPR097W 3222 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RAV1YJR033C 4074 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 PEX4YGR133W 552 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YLR302CYLR302C 363 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 IGO1YNL157W 507 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 GIN4YDR507C 3429 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 TCB2YNL087W 3537 nt2.39□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 LEU3YLR451W 2661 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YGR283CYGR283C 1026 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 AYT1YLL063C 1425 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 ATP18YML081C-A 180 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 ERG29YMR134W 714 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 ARF3YOR094W 552 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YOR364WYOR364W 369 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YBR209WYBR209W 318 nt2.38□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 GAL80YML051W 1308 nt2.38□□□□□ -2.03
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