Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NECAP2Q9NVZ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NECAP2Q9NVZ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms