Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM106CQ9BVX2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM106CQ9BVX2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms