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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
ECM21
YBL101C
3354 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
RRI2
YOL117W
1938 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
GPI19
YDR437W
423 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
RTS3
YGR161C
792 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
PAU23
YLR037C
375 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
YNL179C
YNL179C
438 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
MPP6
YNR024W
561 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
DNL4
YOR005C
2835 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
ESL1
YIL151C
3357 nt
2.53
□□□□□ -2
VAM3
Q12241
GCV2
YMR189W
3105 nt
2.53
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
HEH2
YDR458C
1992 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YDR239C
YDR239C
2364 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GCD10
YNL062C
1437 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YDR210W-A
YDR210W-A
1317 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
SNF12
YNR023W
1701 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
TIF35
YDR429C
825 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
CHZ1
YER030W
462 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YER189W
YER189W
369 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YGL063C-A
YGL063C-A
150 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
FYV4
YHR059W
393 nt
2.52
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
snR76
snR76
109 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ADK1
YDR226W
669 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RPS17B
YDR447C
411 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YGL042C
YGL042C
306 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YGR293C
YGR293C
462 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
DFG10
YIL049W
762 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
BUD19
YJL188C
309 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RLP24
YLR009W
600 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YLR297W
YLR297W
390 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RPL19B
YBL027W
570 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
MRPL33
YMR286W
261 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RIO2
YNL207W
1278 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YNR021W
YNR021W
1215 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RBL2
YOR265W
321 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YOR331C
YOR331C
558 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
TRA1
YHR099W
11235 nt
2.51
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GDI1
YER136W
1356 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GEA1
YJR031C
4227 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YBT1
YLL048C
4986 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
tF(GAA)D
tF(GAA)D
73 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
tF(GAA)N
tF(GAA)N
73 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YER175W-A
YER175W-A
165 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
HRI1
YLR301W
735 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
CSI1
YMR025W
888 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YMR304C-A
YMR304C-A
351 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
HHT2
YNL031C
411 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
FPR1
YNL135C
345 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
COQ10
YOL008W
624 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YOL134C
YOL134C
390 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ARF3
YOR094W
552 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YPL034W
YPL034W
498 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
MEI5
YPL121C
669 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ACM1
YPL267W
630 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ALG14
YBR070C
714 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ARR2
YPR200C
393 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
Q0017
Q0017
162 nt
2.5
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
CDC20
YGL116W
1833 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
SUL1
YBR294W
2580 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
snR84
snR84
550 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RRT13
YER066W
558 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YIL029C
YIL029C
429 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YNL046W
YNL046W
519 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
SWS2
YNL081C
432 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YOR385W
YOR385W
873 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
LCL1
YPL056C
306 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ISU1
YPL135W
498 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YBR071W
YBR071W
636 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YPR172W
YPR172W
603 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PFF1
YBR074W
2931 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
TPS2
YDR074W
2691 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YIL166C
YIL166C
1629 nt
2.49
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YGR067C
YGR067C
2415 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YDL016C
YDL016C
303 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PPH3
YDR075W
927 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
HYP2
YEL034W
474 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GLC7
YER133W
939 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
OTU2
YHL013C
924 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
BET4
YJL031C
984 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YAL026C-A
YAL026C-A
438 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
STE18
YJR086W
333 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YLR302C
YLR302C
363 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RGM1
YMR182C
636 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
NSL1
YPL233W
651 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GPI17
YDR434W
1605 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
ESC1
YMR219W
4977 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
GYP7
YDL234C
2241 nt
2.48
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PNC1
YGL037C
651 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YGR107W
YGR107W
450 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PRS3
YHL011C
963 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YIR020C
YIR020C
303 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YJR141W
YJR141W
1044 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YLR252W
YLR252W
306 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YMR013C-A
YMR013C-A
150 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
RCN2
YOR220W
798 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YPR096C
YPR096C
303 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
LOA1
YPR139C
903 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
YKU80
YMR106C
1890 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PAM1
YDR251W
2493 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
SSF1
YHR066W
1362 nt
2.47
□□□□□ -2.01
VAM3
Q12241
PSK2
YOL045W
3306 nt
2.47
□□□□□ -2.01
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