Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 GPI19YDR437W 423 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 GCD10YNL062C 1437 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YNR021WYNR021W 1215 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YOL150CYOL150C 312 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YOR385WYOR385W 873 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 YME2YMR302C 2553 nt2.55□□□□□ -2
SKO1Q02100 DBP7YKR024C 2229 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 SNF12YNR023W 1701 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 ADK1YDR226W 669 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 PRE1YER012W 597 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 SLX9YGR081C 633 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 COG2YGR120C 789 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 CSE4YKL049C 690 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 GMC2YLR445W 567 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 YNL179CYNL179C 438 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 COQ10YOL008W 624 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 YOL134CYOL134C 390 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 ISU1YPL135W 498 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 YGR067CYGR067C 2415 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 ROG1YGL144C 2058 nt2.54□□□□□ -2
SKO1Q02100 IKI3YLR384C 4050 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 CAF120YNL278W 3183 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 HEH2YDR458C 1992 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 snR76snR76 109 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 RPS17BYDR447C 411 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 RRT13YER066W 558 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 SDH3YKL141W 597 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 RPS1AYLR441C 768 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 RIM9YMR063W 720 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 RGM1YMR182C 636 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 MRPL33YMR286W 261 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 OST2YOR103C 393 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 ARR2YPR200C 393 nt2.53□□□□□ -2
SKO1Q02100 YDL187CYDL187C 330 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RPL23BYER117W 414 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YGL042CYGL042C 306 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 SCEIQ0160 708 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 LRP1YHR081W 555 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 CKA1YIL035C 1119 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RIO2YNL207W 1278 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YOR364WYOR364W 369 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YPL034WYPL034W 498 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 FLO11YIR019C 4104 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 TPS2YDR074W 2691 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 CDC20YGL116W 1833 nt2.52□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 TLC1TLC1 1301 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 GPI17YDR434W 1605 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YIL166CYIL166C 1629 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RRI2YOL117W 1938 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YDL009CYDL009C 324 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YDR209CYDR209C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 HMF1YER057C 390 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 GLC7YER133W 939 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YER189WYER189W 369 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 MPO1YGL010W 525 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YLR271WYLR271W 825 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 COX14YML129C 213 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 AFR1YDR085C 1863 nt2.51□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YGR018CYGR018C 330 nt2.5□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RPL36AYMR194W 303 nt2.5□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 HHT2YNL031C 411 nt2.5□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RPS12YOR369C 432 nt2.5□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 ECM29YHL030W 5607 nt2.5□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 GDI1YER136W 1356 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YOR296WYOR296W 3870 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YDR029WYDR029W 315 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YLR302CYLR302C 363 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YNL046WYNL046W 519 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 SWM2YNR004W 441 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YOR331CYOR331C 558 nt2.49□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 SDC25YLL016W 3147 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RLI1YDR091C 1827 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YHL005CYHL005C 393 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 OTU2YHL013C 924 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 DFG10YIL049W 762 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 BUD19YJL188C 309 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 HRI1YLR301W 735 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RPL6AYML073C 531 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 RBL2YOR265W 321 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 DBP10YDL031W 2988 nt2.48□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 PEA2YER149C 1263 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 EMC4YGL231C 573 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 PRS3YHL011C 963 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 VPH2YKL119C 648 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 SMA2YML066C 1110 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 SWS2YNL081C 432 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 NSL1YPL233W 651 nt2.47□□□□□ -2.01
SKO1Q02100 PSK2YOL045W 3306 nt2.46□□□□□ -2.02
SKO1Q02100 CHZ1YER030W 462 nt2.46□□□□□ -2.02
SKO1Q02100 RPS22AYJL190C 393 nt2.46□□□□□ -2.02
SKO1Q02100 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.46□□□□□ -2.02
SKO1Q02100 MDM1YML104C 3384 nt2.46□□□□□ -2.02
SKO1Q02100 YNL034WYNL034W 1839 nt2.46□□□□□ -2.02
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