Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 AIM36YMR157C 768 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YNL043CYNL043C 321 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PHO80YOL001W 882 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 PET123YOR158W 957 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 TCB2YNL087W 3537 nt2.84□□□□□ -1.95
YBL055CP34220 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.84□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 NMA111YNL123W 2994 nt2.84□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 DAL5YJR152W 1632 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 ORC1YML065W 2745 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YDL009CYDL009C 324 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RSR1YGR152C 819 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 COX14YML129C 213 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YNL122CYNL122C 348 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YPR096CYPR096C 303 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SOK1YDR006C 2706 nt2.83□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 PSY2YNL201C 2577 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YDR199WYDR199W 366 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RPS26BYER131W 360 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SYS1YJL004C 612 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 VPS51YKR020W 495 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RPL20AYMR242C 519 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 TOA1YOR194C 861 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 VID24YBR105C 1089 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 PHR1YOR386W 1698 nt2.82□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RGR1YLR071C 3249 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YPL150WYPL150W 2706 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 VAR1Q0140 1197 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SNU56YDR240C 1479 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 KIN82YCR091W 2163 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SRB8YCR081W 4284 nt2.81□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 BCK1YJL095W 4437 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 ESL2YKR096W 3588 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 MES1YGR264C 2256 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SSF1YHR066W 1362 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 APC11YDL008W 498 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 DFG10YIL049W 762 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 AFB1YLR040C 675 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 COA4YLR218C 453 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 OST2YOR103C 393 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 BOI1YBL085W 2943 nt2.8□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 NAB3YPL190C 2409 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RVS161YCR009C 798 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 HNT1YDL125C 477 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YGL042CYGL042C 306 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YGR045CYGR045C 363 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SPO13YHR014W 876 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 MBB1YJL199C 327 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 FYV7YLR068W 456 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.79□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SAP1YER047C 2694 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 NET1YJL076W 3570 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RTT10YPL183C 3042 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YCR001WYCR001W 315 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YGL015CYGL015C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 TIM10YHR005C-A 282 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 RPF1YHR088W 888 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 MRP49YKL167C 414 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 HRI1YLR301W 735 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 MRPL44YMR225C 297 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 CAT5YOR125C 702 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YPR014CYPR014C 330 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 snR191snR191 274 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 YHR078WYHR078W 1659 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 SRO77YBL106C 3033 nt2.78□□□□□ -1.96
YBL055CP34220 AYT1YLL063C 1425 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 SEN54YPL083C 1404 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 CYR1YJL005W 6081 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RPL9AYGL147C 576 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 TCD1YHR003C 1290 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 BAT1YHR208W 1182 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YAL037WYAL037W 804 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 BI4Q0120 1917 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 CDC55YGL190C 1581 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 NFT1YKR103W 3657 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 AI2Q0055 2565 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RSN1YMR266W 2862 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 TRZ1YKR079C 2517 nt2.77□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 BFR1YOR198C 1413 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 RGL1YPL066W 1440 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 MET6YER091C 2304 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 SEC26YDR238C 2922 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 MXR1YER042W 555 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 ERG28YER044C 447 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 OTU2YHL013C 924 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YLR230WYLR230W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YLR379WYLR379W 375 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YNL179CYNL179C 438 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.76□□□□□ -1.97
YBL055CP34220 YOL057WYOL057W 2136 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.1 ms