Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GTF2E1P29083 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E1P29083 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms